结论前置：在您不知情的情况下甲方将土地流转，流转费用的归属需根据土地权属及流转合同的具体情况来确定，一般而言，若土地属于您所有或您有合法使用权，流转费用应归您所有；若土地属于甲方所有且流转行为合法，但甲方未经您同意流转了您有权益的土地，您有权要求甲方赔偿相应损失。以下从不同情况为您详细分析：
一、土地权属明确为甲方所有，但流转行为可能侵犯您权益的情况
若您对土地有合法使用权（如租赁、承包等）：
- 法律背景：根据《民法典》及相关土地管理法规，土地使用权人依法对其使用的土地享有占有、使用和收益的权利。若甲方未经您同意，擅自流转了您有合法使用权的土地，这侵犯了您的土地使用权。
- 流转费用归属：在此情况下，流转费用原则上应归土地所有权人（甲方）所有，但您有权要求甲方赔偿因流转行为给您造成的损失，包括但不限于因土地被流转而失去的预期收益、搬迁费用等。
- 建议行动：您应首先与甲方协商，要求其停止侵权行为并赔偿损失；若协商无果，您可以向当地土地管理部门投诉或向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
若您对土地无合法使用权，但流转行为给您造成了实际损失：
- 法律背景：即使您对土地无合法使用权，若甲方的流转行为给您造成了实际损失（如因土地被流转导致您的相邻权受到侵害等），您仍有权要求甲方赔偿。
- 流转费用归属：流转费用仍归土地所有权人（甲方）所有，但您可就实际损失部分向甲方主张赔偿。
- 建议行动：收集相关证据，证明甲方的流转行为与您所受损失之间的因果关系，然后与甲方协商赔偿事宜；若协商不成，可依法提起诉讼。
二、土地权属存在争议或您认为您对土地有权益的情况
若土地权属存在争议：
- 法律背景：在土地权属存在争议的情况下，任何一方都不得擅自改变土地利用现状或进行流转。若甲方在争议期间擅自流转土地，这可能构成违法行为。
- 流转费用归属：在权属争议解决前，流转费用的归属可能暂时无法确定。但一旦权属明确，若流转行为被认定为合法，费用将归土地所有权人所有；若被认定为违法，则可能面临返还或赔偿等法律后果。
- 建议行动：您应尽快向当地土地管理部门申请确权，明确土地权属；在确权过程中，若发现甲方有擅自流转土地的行为，可及时向相关部门投诉或提起诉讼。
若您认为您对土地有权益（如基于历史原因、口头协议等）：
- 法律背景：在法律上，权益的认定需要基于明确的法律关系和证据。若您认为您对土地有权益，但缺乏书面证据或法律认可，这可能会给您的维权带来一定困难。
- 流转费用归属：在权益未得到法律确认前，流转费用原则上仍归土地所有权人（甲方）所有。但您可尝试通过协商、调解等方式与甲方就费用分配达成一致；若协商无果，且您认为自己的权益确实受到了侵害，可依法提起诉讼或申请仲裁。
- 建议行动：收集相关证据（如证人证言、历史文件等），证明您对土地的权益；然后与甲方协商费用分配事宜；若协商不成，可考虑通过法律途径解决争议。
最后，土地流转是一个复杂的法律问题，涉及多方权益和法律关系。在处理此类问题时，建议您保持冷静、理性，并尽快咨询专业律师（即我本人，安笑石律师，专注于合同纠纷、婚姻家庭领域），以便更好地维护自己的合法权益。