公司与社区签订土地协议后能否开发房产，需根据土地性质、协议内容及是否履行法定程序综合判断，具体如下：

1. 土地性质决定开发权限
   根据《土地管理法》，土地分为国有土地和集体土地：

   • 国有土地：若社区代表政府（如街道办）签订协议，且土地用途已通过规划部门批准为“居住用地”或“商业用地”，公司可依法开发房产，但需通过“招拍挂”程序取得土地使用权，并办理《国有土地使用证》《建设用地规划许可证》等手续。
     
   • 集体土地：若土地为集体所有（如宅基地、集体建设用地），公司需先将土地性质转为国有（通过征收或集体经营性建设用地入市），或符合《土地管理法》第63条规定的“集体经营性建设用地直接入市”条件（如用于工业、商业等经营性用途），方可开发房产。直接签订协议开发可能涉嫌违法。

2. 协议内容需符合法律强制性规定
   即使土地性质允许开发，协议也需明确约定以下内容，否则可能无效：

   • 土地用途：必须明确为“房地产开发”，若协议约定为“合作建房”“租赁”等模糊表述，可能被认定为规避法律。
     
   • 审批义务：约定由哪方负责办理规划、施工、预售等许可，若未约定或约定由无资质方办理，可能导致开发行为违法。
     
   • 权益分配：需符合《民法典》关于“共有物处分”的规定，若土地为多人共有（如集体土地成员），需经法定比例成员同意，否则协议可能因“无权处分”被撤销。

3. 未履行法定程序的法律风险
   即使协议合法，若未履行以下程序，开发行为仍可能被叫停或处罚：

   • 规划许可：未取得《建设工程规划许可证》擅自施工，可能面临罚款、拆除（依据《城乡规划法》第64条）。
     
   • 施工许可：未取得《建筑工程施工许可证》开工，可能被责令停工、罚款（依据《建筑法》第64条）。
     
   • 预售许可：未取得《商品房预售许可证》销售房屋，购房者有权要求退房并索赔（依据《城市房地产管理法》第45条）。

建议：若公司已与社区签订协议，需立即核查土地性质、协议内容及审批进度。若存在瑕疵，建议通过补充协议、申请补办手续等方式完善；若土地性质无法变更或协议存在重大违法条款，需及时止损，避免因行政处罚或民事纠纷导致更大损失。如有具体协议文本或土地信息，可进一步向我咨询细节。