申请羁押必要性审查不通过，检察院是会通知申请人的。这一结论基于以下法律背景和程序要求：
一、法律依据与程序要求
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第九十五条的规定，犯罪嫌疑人、被告人被逮捕后，人民检察院仍应当对羁押的必要性进行审查。这一审查程序不仅体现了对犯罪嫌疑人、被告人人权的尊重与保护，也是司法机关依法行使职权、确保司法公正与透明的重要保障。在审查过程中，如果检察院认为不需要继续羁押的，应当建议予以释放或者变更强制措施，并通知有关机关。同样地，如果检察院经审查认为不符合继续羁押的条件，决定不予立案的，也应当将这一决定通知申请人。
二、通知的内容与形式
内容要素：
- 羁押必要性审查不立案通知书通常会包含申请人信息、案件信息、审查结果、法律依据以及理由说明等要素。
- 其中，审查结果会明确告知申请人不予立案的决定，理由说明则会附上简要的理由，解释为何不符合羁押条件。
形式要求：
- 通知书通常以书面形式送达申请人，并做好签收记录，以确保申请人确实收到了告知书并了解了其权利。
- 这种书面通知的形式不仅具有法律效力，也体现了司法程序的规范性和严肃性。
三、通知的意义与作用
保障申请人知情权：
- 通过通知申请人羁押必要性审查的结果，检察院保障了申请人的知情权，使其能够及时了解案件进展情况和自己的权利状态。
提供申诉途径：
- 如果申请人对检察院的决定不服，可以根据通知书中的指引，依法向上一级人民检察院提出申诉，以维护自身合法权益。
体现司法公正与透明：
- 羁押必要性审查不立案通知书的发出，也体现了司法机关在办理案件过程中的公正性和透明度，有助于增强公众对司法制度的信任和支持。
四、实际操作中的注意事项
仔细阅读通知书内容：
- 申请人在收到羁押必要性审查不立案通知书后，应首先仔细阅读通知书内容，了解不予立案的具体理由和法律依据。
依法行使申诉权：
- 如果申请人认为通知书中的决定有误或存在不当之处，有权依法向上一级人民检察院提出申诉，以维护自身合法权益。
配合司法机关工作：
- 在申诉过程中，申请人应积极配合司法机关的工作，提供必要的证据和材料，以便司法机关能够更全面地了解案件情况并作出公正裁决。
综上所述，申请羁押必要性审查不通过时，检察院是会通知申请人的。这一制度不仅保障了申请人的知情权和申诉权，也体现了司法机关的公正性和透明度。如果您在刑事案件中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。