针对您提出的“非法营运怎么处罚，是否扣分”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、非法营运的定义

非法营运，指的是未依法取得营运权而擅自从事道路运输经营的行为。这包括未取得道路运输经营许可、使用失效或伪造的证件、超越许可事项从事道路运输经营等多种情形。若没有金钱交易行为或不能查证有金钱交易行为，则不构成非法营运。

二、非法营运的处罚措施

1. 责令停止经营：一旦发现非法营运行为，县级以上道路运输管理机构会立即责令其停止经营，以防止违法行为继续扩大。

2. 没收违法所得并罚款：

   • 对于有违法所得的，将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
   • 若没有违法所得或违法所得不足2万元，将处以3万元以上10万元以下的罚款。

3. 追究刑事责任：若非法营运行为构成犯罪，如非法经营罪，将依法追究刑事责任，这可能包括有期徒刑、罚金或没收财产等更严重的处罚。

4. 其他附加处罚：非法营运的车辆可能会被扣押或吊销相关证件。同时，从事非法营运的个人或单位还可能面临信用记录受损、行业禁入等长期影响。

三、关于扣分的问题

在非法营运的处罚中，通常并不直接涉及扣分。扣分制度主要应用于交通违法行为，如超速、闯红灯等，这些行为与非法营运的性质不同。非法营运的处罚更侧重于罚款、没收违法所得、责令停止经营以及可能的刑事责任追究。

四、特殊情况与地区差异

• 对于初次非法营运且情节轻微，当事人积极配合调查处理等情形，执法机关在法定处罚幅度内可能会考虑从轻处罚。但这一决定会综合考虑违法情节、危害后果等多种因素。
• 各地实际情况不同，部分地区可能会根据实际情况出台细化的规定和裁量标准。因此，在具体处罚时，可能会因地区和政策的不同而有所差异。

五、建议与总结

非法营运行为不仅扰乱了市场秩序，还可能损害乘客的合法权益。因此，我强烈建议从事道路运输经营的个人和单位务必严格遵守相关法律法规，确保合法合规经营。若您对具体的法律问题或案例有疑问，建议向当地的法律咨询机构或专业律师进行详细咨询，他们能够根据具体情况提供更准确的法律意见和帮助。

综上所述，非法营运的处罚措施严厉且全面，但通常并不直接涉及扣分。希望以上解答能够对您有所帮助。