结论：在高铁上被查公章后让您离开，这一行为本身并不直接构成违法，但具体是否违法需结合查验公章的合法性、查验人员的身份及查验程序等因素综合判断。以下从多个角度进行分析：

一、查验公章的合法性基础

1. 公章的法律意义：公章是单位或组织的重要法律凭证，具有证明单位身份、确认文件效力等法律功能。因此，对公章的查验，通常与单位或组织的身份确认、文件真实性核实等法律行为相关联。

2. 查验公章的合法情形：

   • 执法机关查验：如公安机关、市场监管部门等执法机关，在依法执行职务时，有权对涉嫌违法或需要调查的单位或个人的公章进行查验。这种查验行为是合法的，且被查验方有义务配合。
   • 合同或业务往来中的查验：在合同签订、业务合作等民事活动中，一方为了确认对方的身份和文件真实性，可能会要求查验对方的公章。这种查验行为在双方自愿且不违反法律法规的前提下，也是合法的。

二、查验公章人员的身份及查验程序

1. 执法人员身份：如果查验公章的人员是执法机关的工作人员，且他们出示了有效的执法证件，那么他们的查验行为是合法的。您有义务配合他们的查验工作。

2. 查验程序：合法的查验程序通常包括出示执法证件、说明查验目的和依据、制作查验记录等。如果查验人员未按照法定程序进行查验，或者查验行为超出了法定权限，那么他们的查验行为可能是违法的。

三、您被查验后被允许离开的情况

1. 查验无异常：如果查验人员对您的公章进行了查验，并确认公章真实有效，且您未涉及任何违法或需要进一步调查的事项，那么他们可能会允许您离开。这种情况下，您的离开是合法的，不构成任何违法行为。

2. 查验程序违法或查验人员身份不合法：如果查验人员的身份不合法（如冒充执法人员），或者查验程序违法（如未出示执法证件、未说明查验目的和依据等），那么他们的查验行为可能是违法的。在这种情况下，即使他们允许您离开，也不意味着他们的行为是合法的。但您的离开行为本身并不构成违法。

四、可能涉及的法律后果及建议

1. 如果查验行为合法：您应配合查验工作，提供必要的协助。如果因查验行为给您造成了不必要的损失或困扰，您可以依法向相关部门投诉或寻求法律救济。

2. 如果查验行为违法：您可以拒绝配合查验，并有权向相关部门举报或投诉。同时，您可以保留相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。

建议：在遇到类似情况时，您应首先确认查验人员的身份和查验程序的合法性。如果查验行为合法，您应积极配合；如果查验行为违法或存在疑问，您可以拒绝配合并寻求法律帮助。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。