法院以土地权属有争议为由驳回您的侵权诉讼请求，并不必然构成程序违法，但需结合具体案情判断其合法性。以下从不同角度为您详细分析：
一、程序合法的情形
权属争议作为前置问题：
- 在土地侵权纠纷中，如果土地权属存在争议，且该争议是侵权认定和责任划分的基础，那么法院在审理过程中有权要求当事人先解决权属争议。这是因为，土地权属的确定是侵权诉讼的前提和基础，如果权属不明，则无法准确判断侵权行为是否成立以及侵权责任的承担。
- 法律依据：虽然直接的法律条文可能并未明确规定此类情形下的程序要求，但根据《民事诉讼法》中关于“起诉必须符合的条件”以及“人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出”等规定，可以推导出，如果土地权属争议影响案件管辖或实体审理，法院有权要求当事人先解决权属争议。此外，一些地方性法规或司法解释也可能对此类情形有具体规定。
法院的释明义务：
- 在审理过程中，如果法院发现土地权属存在争议，且该争议可能影响案件的审理结果，法院有义务向当事人释明，并告知当事人可以另行提起权属确认之诉。如果当事人坚持在原侵权诉讼中解决权属问题，而法院认为这不符合审理程序或可能导致审理结果的不公正，法院有权驳回起诉或中止审理，要求当事人先解决权属争议。
二、可能构成程序违法的情形
未依法释明或告知：
- 如果法院在审理过程中发现土地权属存在争议，但未依法向当事人释明或告知其可以另行提起权属确认之诉，而是直接以权属有争议为由驳回起诉，这可能构成程序违法。因为法院有义务保障当事人的诉讼权利，包括告知当事人其可以采取的救济措施。
错误认定权属争议：
- 如果法院在审理过程中错误地认定土地权属存在争议，而实际上权属是清晰的，或者争议并不影响侵权诉讼的审理，那么法院以权属有争议为由驳回起诉也可能构成程序违法。因为这种情况下，法院的驳回决定缺乏事实依据和法律依据。
三、您的应对策略
审查法院裁定：
- 首先，您需要仔细审查法院驳回起诉的裁定书，了解法院驳回的具体理由和依据。如果裁定书中未明确说明权属争议的具体情况或未依法释明，您可以考虑提出异议或上诉。
另行提起权属确认之诉：
- 如果土地权属确实存在争议，且该争议是侵权诉讼的前提和基础，您可以考虑另行提起权属确认之诉，以明确土地权属。在权属确认后，您可以再提起侵权诉讼，要求侵权人承担侵权责任。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂案件时，建议您咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况和案件事实，为您提供更具体的法律建议和诉讼策略。
总结来说，法院以土地权属有争议为由驳回您的侵权诉讼请求，并不必然构成程序违法。但您需要仔细审查法院的裁定书，了解驳回的具体理由和依据，并根据实际情况采取相应的应对策略。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。