交通执法部门对停在施工区域的违法车辆，确实有扣留的权利。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据角度

根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，交通执法部门（通常指公安机关交通管理部门）有权对违反道路交通安全法律、法规关于机动车停放、临时停车规定的车辆，采取拖移等强制措施。施工区域往往属于道路的一部分，且由于施工活动的特殊性，对车辆的停放有更为严格的要求。如果车辆违法停放在施工区域，不仅可能妨碍施工活动的正常进行，还可能对施工人员的安全以及过往车辆和行人的安全构成威胁。因此，交通执法部门有权依据相关法律法规，对这类违法车辆进行扣留或拖移。

实际执法角度

在实际执法过程中，交通执法部门会综合考虑多种因素来决定是否扣留违法车辆。这些因素包括但不限于：违法停车的严重程度、是否对施工活动造成了实际妨碍、是否对公共安全构成了威胁等。如果车辆只是轻微违法停放，且未对施工活动或公共安全造成明显影响，交通执法部门可能会选择采取警告、罚款等较轻的处罚措施。然而，如果车辆违法停放情况严重，或者已经对施工活动或公共安全造成了实际妨碍或威胁，那么交通执法部门就有权扣留该车辆，以维护道路交通秩序和公共安全。

后续处理角度

对于被扣留的违法车辆，交通执法部门会按照相关法律法规的规定进行处理。这通常包括将车辆拖移至指定地点停放，并通知车主前来接受处理。车主在接到通知后，需要按照要求前往交通执法部门接受处罚，并缴纳相应的罚款。如果车主逾期不接受处理或者拒不缴纳罚款，交通执法部门还有权依法对车辆进行进一步处理，如拍卖、报废等。

建议：

• 作为车主，应严格遵守道路交通安全法律、法规的规定，不要违法停放车辆，特别是在施工区域等特殊地段。
• 如果因特殊情况需要临时停车，应选择合法的停车地点，并设置明显的警示标志，以提醒其他车辆和行人注意。
• 如果车辆被交通执法部门扣留，应积极配合执法部门的工作，按照要求接受处理并缴纳罚款，以避免不必要的法律纠纷和损失。

如果你有任何关于交通运输领域的法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业、全面的解答。