没有双方公章的协议并不必然无效，其有效性需结合协议主体、双方意思表示、实际履行情况以及相关法律规定等多方面因素综合判断。以下是对这一问题的详细分析：

一、协议有效的基本条件

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为（包括协议）要有效，必须满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：即协议双方必须是具有完全民事行为能力的自然人、法人或其他组织。
2. 意思表示真实：协议内容必须是双方真实、自愿的意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议内容必须合法，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公共利益和善良风俗。

二、不同情况下协议的有效性分析

（一）自然人之间的协议

• 法律效力：自然人之间订立协议，一般不需要加盖公章。自然人在协议上签字或按指印即具有法律效力。
• 有效性条件：只要协议是双方真实意思表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，即使没有公章，协议也是有效的。

举例：甲乙两人签订了一份借款协议，约定甲向乙借款10万元，双方签字确认。该协议即使没有加盖公章，也是有效的，因为双方都是自然人，且协议内容合法合规。

（二）涉及法人或其他组织的协议

1. 仅有法定代表人或负责人签字：
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第六十一条，法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。
   • 有效性：即便协议书上没有加盖公章，但有法定代表人或负责人签字，且协议内容合法合规，该协议通常有效。

举例：A公司与B公司签订了一份采购合同，A公司的法定代表人签字确认，但合同未加盖公章。由于法定代表人签字代表了公司的真实意思表示，且合同内容合法，因此该合同有效。

1. 没有公章且无法定代表人或负责人签字，但有授权代表签字：
   • 授权要求：如果签订协议的人是经过法人或非法人组织授权的代表，并能提供相应的授权委托书等证明文件。
   • 有效性：在此情况下，即便没有加盖公章，授权代表的签字也能代表该组织的意思表示，协议可能有效。

举例：C公司委托其员工D代表公司与E公司签订了一份销售合同，D提供了授权委托书并在合同上签字，但合同未加盖C公司公章。由于D是经过授权的代表，其签字代表了C公司的真实意思表示，因此该合同有效。

1. 没有公章且无相关人员签字：
   • 一般情况：若协议上既没有公章，也没有法定代表人、负责人或授权代表的签字，通常很难认定该协议是法人或非法人组织的真实意思表示，因此协议不成立也就无效。
   • 特殊情况：但如果法人或非法人组织已经实际履行了协议主要义务，且对方也接受，根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，该合同成立且可能有效。

举例：F公司与G公司签订了一份合作协议，但协议上既没有加盖公章，也没有相关人员签字。然而，F公司已经按照协议约定向G公司支付了合作费用，G公司也接受了该费用并开始履行合作义务。在此情况下，尽管协议形式上存在瑕疵，但由于双方已经实际履行了协议主要义务，因此该协议可能被认定为有效。

三、综合分析与建议

在判断没有双方公章的协议是否有效时，应综合考虑协议主体的民事行为能力、双方的真实意思表示、协议的合法性以及实际履行情况等因素。如果协议内容合法合规，且双方已经实际履行了协议主要义务，即使没有加盖公章，该协议也可能被认定为有效。然而，为了避免潜在的法律风险，建议在实际操作中尽量按照法律规定的要求来签订和盖章协议。

如果您在签订或履行协议过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。