核心结论：您在异地不合规城市用双证跑滴滴时被追尾，处理方式主要取决于事故责任认定，同时您需关注自身运营合规性对事故处理及后续责任承担的影响，以下是具体分析。

事故责任认定及常规处理流程

1. 立即停车并保护现场：发生追尾事故后，您应立即停车，开启危险报警闪光灯，在车后适当位置放置警示标志，以防止二次事故发生。这是《道路交通安全法》规定的义务，若未履行可能承担相应责任。
2. 查看人员伤亡情况并报警：检查自己和对方车辆上人员是否受伤，如有受伤，及时拨打120急救电话。同时，无论事故轻重，都应拨打122报警，等待交警到现场处理。交警会通过勘查现场、询问当事人等方式，确定事故责任。
3. 收集证据：在等待交警到来期间，您可以用手机拍摄事故现场照片，包括车辆碰撞部位、车辆在道路上的位置、周围环境等，同时记录对方车辆的车牌号、驾驶员信息等。这些证据对于后续确定责任和理赔非常重要。
4. 等待交警出具事故责任认定书：交警会根据调查结果，出具事故责任认定书，明确双方的责任比例。这是后续处理事故的重要依据。

结合您运营不合规情况的特殊考量

1. 对事故责任认定可能的影响：虽然运营不合规与事故发生本身可能没有直接因果关系，但如果对方能够证明您的运营不合规行为对事故的发生起到了一定作用，例如因您违规停车上下客导致后方车辆追尾，那么可能会影响事故责任的认定，您可能需要承担比正常情况下更重的责任。不过，一般情况下，追尾事故通常后车负主要或全部责任，但具体仍需根据实际情况判断。
2. 对保险理赔的影响：如果您购买了车辆保险，在事故发生后应及时向保险公司报案。然而，由于您在不合规城市运营滴滴，这可能违反了保险合同中的相关条款。许多保险合同约定，车辆用于非法营运等非保险合同约定的用途时，保险公司有权拒绝赔偿。因此，保险公司可能会以您运营不合规为由拒绝理赔。但如果保险公司无法证明您此次事故与运营不合规有直接关联，或者您能够提供证据证明事故发生时并非处于营运状态，仍有可能获得部分或全部赔偿。
3. 可能面临的行政处罚：除了事故处理本身，您在异地不合规城市跑滴滴还可能面临交通运输管理部门的行政处罚。根据相关规定，未取得经营许可，擅自从事或者变相从事网约车经营活动的，由县级以上出租汽车行政主管部门责令改正，予以警告，并处以罚款等处罚。

建议采取的措施

1. 积极配合事故处理：按照上述常规处理流程，积极配合交警和保险公司的工作，如实提供相关信息和证据。
2. 咨询专业意见：由于您的情况较为复杂，涉及事故责任认定、保险理赔和行政处罚等多个方面，建议您在处理过程中咨询专业的法律人士或保险理赔专家，以便更好地维护自己的合法权益。
3. 规范运营行为：为了避免类似情况再次发生，建议您尽快了解并遵守当地的网约车运营规定，办理相关手续，合法合规地从事网约车经营活动。

如果您在处理过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供详细、专业的解答。