关于自产农产品证明公章能否盖村里章的问题，这主要取决于具体的规定和实际情况。以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据广东省人民政府一九五一年的相关通知，农、渔、猎、牧户自产自销物品需要凭村以上政府之证明来免征临商税。这里明确提到了“村以上政府”，在实际情况中，村委会作为村一级的政府组织，其公章在符合规定的情况下是可以用于此类证明的。

其次，从集安市人民政府城东街道办事处发布的关于进一步加强村级公章管理工作的通知中，我们可以了解到，村委会的公章管理有严格的规定和程序。村委会可以出具多种证明，包括但不限于居民身份、居住地址、贫困证明等，同时也明确列出了不准盖章的材料，如空白纸张、弄虚作假的证明等。对于自产农产品的证明，如果其内容真实、符合实际情况，且经过了村委会的审核和确认，那么使用村委会的公章是合理的。

然而，需要注意的是，虽然村委会的公章在理论上可以用于自产农产品的证明，但具体操作时还需遵循以下原则：

1. 真实性原则：证明的内容必须真实可靠，不得弄虚作假。村委会在出具证明时，应对申请人的自产农产品情况进行核实，确保其真实性。

2. 合规性原则：证明的出具必须符合相关法律法规和政策规定。村委会应了解并遵守关于自产农产品证明的相关规定，确保出具的证明合法有效。

3. 程序性原则：公章的使用必须遵循规定的程序。在出具自产农产品证明时，村委会应按照公章管理规定，通过“智慧云章”管理系统等正规渠道进行申请、审核和盖章。

综上所述，如果自产农产品的证明内容真实、符合实际情况，且经过了村委会的审核和确认，同时遵循了公章使用的相关规定和程序，那么使用村委会的公章是可以的。但为了避免不必要的麻烦和风险，建议您在出具证明前与当地税务部门或相关机构进行沟通确认，以确保证明的合法性和有效性。