质证意见通常是在庭审过程中以口头或书面形式直接向法庭提交的，而非仅仅在材料里面提交。不过，具体提交方式可能会因案件类型、法院要求以及具体诉讼阶段的不同而有所差异。以下是对这一问题的详细分析：
一、质证意见的基本提交方式
口头提交：在庭审过程中，当事人或其代理人会就对方提交的证据进行质证，并口头发表质证意见。这种方式灵活、直接，能够迅速回应对方的证据和观点。
书面提交：除了口头提交外，当事人或其代理人也可以选择以书面形式提交质证意见。书面质证意见通常更加详细、全面，能够充分阐述己方的观点和理由。在提交书面质证意见时，需要确保意见内容清晰、准确，并附上相关证据材料以支持己方观点。
二、质证意见在材料中的体现
虽然质证意见本身不是仅仅在材料里面提交的，但在准备质证意见的过程中，当事人或其代理人确实需要仔细研究对方提交的证据材料，并据此形成自己的质证意见。这些证据材料作为质证意见的基础和依据，会被整理成案卷材料的一部分。然而，这并不意味着质证意见就等同于这些材料，或者仅仅是在材料里面提交的。
三、不同情况下的质证意见提交
简易程序与普通程序：在简易程序中，由于案件相对简单，质证意见可能更加简洁明了，提交方式也可能更加灵活。而在普通程序中，由于案件复杂程度较高，质证意见可能需要更加详细、全面，提交方式也可能更加正式。
不同法院的要求：不同法院对于质证意见的提交方式可能有不同的要求。有些法院可能要求当事人或其代理人在庭审前提交书面质证意见，以便法院提前了解双方的观点和争议焦点。而有些法院则可能更倾向于在庭审过程中进行口头质证，并当场记录质证意见。
诉讼阶段的不同：在诉讼的不同阶段，质证意见的提交方式也可能有所不同。例如，在举证期限内，当事人或其代理人可能需要提交书面质证意见以回应对方提交的证据。而在庭审过程中，则可能需要根据庭审情况灵活调整质证意见的提交方式。
四、法律建议
提前准备：无论采用何种提交方式，当事人都应提前准备质证意见，确保内容充分、准确。这有助于在庭审过程中更好地维护自己的合法权益。
遵循法院要求：当事人应仔细阅读法院的通知和要求，了解质证意见的提交方式和时间限制。这有助于避免因提交不当而导致的法律风险。
寻求专业帮助：如果当事人对质证意见的提交方式或内容存在疑问，可以寻求专业律师的帮助。律师能够提供专业的法律意见和指导，帮助当事人更好地应对诉讼过程中的各种挑战。
如果您在质证意见的提交或准备过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。