技术协议未盖公章，而盖了技术部门专用章，其效力需分情况讨论：

1. 技术部门专用章具有对外代表公司签订技术协议的权限

   • 法律解释：若公司内部有明确规定或授权，技术部门专用章在特定范围内（如技术协议签订）可代表公司意志，那么该章的使用即视为公司行为，技术协议有效。这通常要求公司有明确的授权文件或内部管理制度作为支撑。
   • 实际建议：在此情况下，建议检查公司章程、内部管理制度或相关授权文件，确认技术部门专用章是否具有签订技术协议的权限。若确认无误，则技术协议有效，双方应按约履行。

2. 技术部门专用章不具有对外代表公司签订技术协议的权限

   • 法律解释：若公司未明确授权技术部门专用章可签订技术协议，或该章的使用范围仅限于内部技术文件、报告等，那么该章的使用可能无法代表公司意志，技术协议可能因缺乏公司公章而效力存疑。此时，需考虑其他因素，如双方实际履行情况、交易习惯等，来判断协议是否有效。
   • 实际建议：
     • 若协议已部分履行：可收集相关证据（如付款记录、交货单等），证明双方已按协议实际履行，从而主张协议有效。
     • 若协议尚未履行或存在争议：建议尽快与公司沟通，要求加盖公司公章或出具书面确认文件，以明确协议效力。若公司拒绝，则需考虑通过法律途径解决争议。

3. 特殊情况下的效力认定

   • 法律解释：在某些特殊情况下，即使技术协议未盖公司公章，也可能因其他因素（如双方长期交易习惯、行业惯例等）而被认定为有效。这通常需要结合具体案情和法律规定进行综合判断。
   • 实际建议：在特殊情况下，建议咨询专业律师，结合具体案情和法律规定，评估技术协议的效力及可能面临的法律风险。

总结与提醒：技术协议未盖公章而盖技术部门专用章的效力，需根据公司内部规定、授权文件及实际履行情况等因素综合判断。为避免潜在的法律风险，建议在签订技术协议时，明确约定协议生效条件（如需加盖公司公章），并在实际履行过程中保留好相关证据。若遇到法律问题，可直接向我咨询，我将结合你的具体情况，提供专业的法律建议。