公司先签电子版合同，审核通过后又让签纸质版合同，这种做法在法律上并不违法，但需根据具体情况判断其合理性与必要性。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律层面：电子合同与纸质合同具有同等法律效力
根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条的规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。因此，电子合同与纸质合同在法律上具有同等的效力。
二、公司做法的可能原因
内部管理需要：公司可能出于内部管理、存档或审计的需要，要求员工在签订电子合同后，再签订纸质版合同作为备份或存档。这种做法虽然增加了流程，但并不违反法律规定。
确保合同真实性：尽管电子合同具有法律效力，但某些情况下，公司可能更倾向于纸质合同，以确保合同的真实性和不可篡改性。然而，随着电子签名技术的成熟和普及，电子合同的真实性和安全性已经得到了广泛认可。
特定行业或业务要求：某些特定行业或业务可能对合同形式有特殊要求，如需要纸质合同作为办理某些手续或业务的必备文件。
三、员工应对建议
了解公司政策：首先，员工应了解公司的相关政策，明确公司要求签订纸质版合同的具体原因和目的。
沟通协商：如果员工对公司的做法有疑问或担忧，可以与公司进行沟通协商，了解公司的意图，并表达自己的看法和需求。例如，如果员工认为签订纸质版合同增加了不必要的负担，可以与公司协商是否可以仅保留电子合同。
保留证据：无论签订电子合同还是纸质版合同，员工都应妥善保管好合同文本和相关证据，以备不时之需。
四、可能存在的法律风险与防范
合同内容一致性：员工在签订纸质版合同时，应仔细核对合同内容是否与电子合同一致，避免出现内容不一致或遗漏的情况。
签名真实性：如果纸质版合同需要员工手写签名，员工应确保签名的真实性，避免被他人冒签或伪造。
公司违约风险：如果公司以签订纸质版合同为条件，对员工进行不合理的限制或要求，员工应警惕公司可能存在的违约风险，并保留好相关证据以维护自己的合法权益。
总结来说，公司先签电子版合同又审核通过后又让签纸质版合同的做法，在法律上并不违法。但员工在面对这种情况时，应了解公司的政策、与公司进行沟通协商，并妥善保管好合同文本和相关证据。如果遇到任何疑问或问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。