上市公司签订的股权回购协议未经股东大会决议，其效力需分情况讨论，不能一概而论。以下是对此问题的详细分析：
一、协议有效的情形
符合法定回购情形且程序瑕疵不影响实质效力：
- 若股权回购协议符合《公司法》规定的法定回购情形（如减少注册资本、与持有本公司股份的其他公司合并、将股份用于员工持股计划或者股权激励、股东因对股东大会作出的公司合并、分立决议持异议要求公司收购其股份等），且程序上的瑕疵（如未召开股东大会）未对协议实质效力产生实质性影响，该协议仍可能被认定为有效。但这种情况较为特殊，且需结合具体案情和司法实践判断。
公司章程或内部规定允许且程序已适当履行：
- 若公司章程或内部规定中明确规定了股权回购的程序，且该程序未要求必须经过股东大会决议，或者虽然要求但已通过其他方式（如董事会决议）适当履行了程序，那么股权回购协议可能有效。不过，对于上市公司而言，由于其涉及公众利益，通常对股权回购的程序要求更为严格。
二、协议可能无效的情形
违反法律法规强制性规定：
- 根据《公司法》及相关法律法规，上市公司回购股份通常需要经过股东大会决议（特别是涉及重大资产重组、减资等情形）。若股权回购协议未经股东大会决议，且该决议是法律、行政法规规定的必备程序，那么该协议可能因违反法律法规强制性规定而无效。
损害其他股东或债权人利益：
- 若股权回购协议未经股东大会决议，且该回购行为损害了其他股东或债权人的合法权益（如通过回购股份操纵股价、损害中小股东利益等），那么该协议可能因恶意串通损害他人利益或违背公序良俗而被认定无效。
意思表示不真实或存在欺诈、胁迫等情形：
- 若股权回购协议的签订过程中存在欺诈、胁迫等情形，导致一方意思表示不真实，那么该协议可能因意思表示不真实而被撤销或认定无效。
三、法律建议与风险防范
严格遵守法律法规和公司章程：
- 上市公司在签订股权回购协议时，应严格遵守《公司法》及相关法律法规的规定，确保回购程序合法合规。同时，应仔细审查公司章程中关于股权回购的规定，确保协议内容与公司章程相符。
履行必要的审批和登记程序：
- 对于需要股东大会决议的股权回购事项，上市公司应按照法定程序召开股东大会并作出决议。同时，应按照相关规定履行信息披露和登记程序，确保回购行为的透明度和合法性。
咨询专业律师进行法律审查：
- 在签订股权回购协议前，上市公司应咨询专业律师进行法律审查，确保协议内容的合法性、合规性及可执行性。律师可以对协议条款进行逐一审查，并提出修改建议或风险提示。
注意保留相关证据和文件：
- 上市公司在签订和履行股权回购协议过程中，应注意保留相关证据和文件（如股东大会决议、董事会决议、回购协议、支付凭证等），以便在必要时证明协议的合法性和有效性。
举例说明：假设某上市公司A计划回购其股东B持有的股份，但未召开股东大会进行决议。若该回购行为不符合《公司法》规定的法定回购情形，且公司章程中也未规定无需股东大会决议即可回购股份，那么该股权回购协议可能因违反法律法规强制性规定而无效。相反，若该回购行为符合法定情形且公司章程中允许通过董事会决议进行回购，且已履行了相关程序，那么该协议可能有效。
综上所述，上市公司签订的股权回购协议未经股东大会决议的效力需根据具体情况判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。