员工赔偿并非一定按照基本工资来计算，而是依据劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定。这一平均工资不仅包含了基本工资，还涵盖了奖金、津贴、补贴等所有货币性收入。以下是对此问题的详细分析：

一、赔偿金的计算基数

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定，经济补偿（赔偿金的一种形式）的计算基数是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。这里的“平均工资”是实际工资，它全面反映了劳动者在该时间段内的实际收入水平，因此，在计算赔偿金时，应将劳动者应得的所有收入都纳入计算范围。

二、赔偿金的计算年限与标准

1. 经济补偿的计算：

   • 按照劳动者在单位工作的年限来计算，每满一年支付一个月的工资作为补偿。
   • 工作六个月以上但不满一年的，按一年计算。
   • 工作不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

2. 特殊情况：

   • 如果劳动者的月平均工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额来支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

三、不同赔偿情形的具体应用

1. 违法解除劳动合同的赔偿金：

   • 如果用人单位违反法律规定解除劳动合同，需要按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。这里的计算基数同样是上述经济补偿所依据的月平均工资。

2. 未签订书面劳动合同的二倍工资差额：

   • 如果用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这里的“二倍工资”实际上包含了已支付的正常工资和额外支付的一倍工资差额，计算时通常以劳动者实际领取的工资为基数。

3. 工伤赔偿中的停工留薪期工资：

   • 职工因工作遭受事故伤害或患职业病需暂停工作接受医疗的，停工留薪期内原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”一般按照工伤职工受伤或患病前12个月的平均月缴费工资确定，也体现了对劳动者实际收入水平的全面考量。

四、实际操作中的注意事项

1. 计算范围全面性：

   • 在计算平均工资时，应确保将劳动者应得的所有收入都纳入计算范围，以全面反映劳动者的实际收入水平。

2. 工作时长考量：

   • 若劳动者工作不满12个月的，应按照实际工作的月数来计算平均工资。

3. 税前工资标准：

   • 辞退赔偿工资在计算时应按照税前工资标准来确定，以更真实地反映劳动者的劳动价值。

举例说明：假设某员工在劳动合同解除前十二个月的平均工资为8000元（其中基本工资5000元，奖金2000元，津贴1000元），工作年限为3年6个月。那么，该员工应获得的经济补偿为：8000元/月 × 4个月（3年按3个月计算，6个月按1个月计算）= 32000元。如果用人单位违法解除劳动合同，则需要支付双倍赔偿金，即64000元。

综上所述，员工赔偿的计算是一个综合考量的过程，涉及多个法律知识点和具体规定。在实际操作中，应根据具体情况准确计算赔偿金额，以确保法律的公正实施和劳动者的合法权益得到保障。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。