您好，关于发票开给合同主体的依据，这主要涉及到我国发票管理的相关法律法规以及实际业务操作中的一些原则。以下是我为您详细梳理的几点依据：

首先，根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务并收取款项时，收款方应当向付款方开具发票。这是发票开具的基本原则，即发票应开给实际付款方。

在实际业务中，合同签约主体与付款主体有时可能会存在分离的情况。例如，员工可能代表单位签订租房合同，但实际付款方是单位。在这种情况下，虽然合同是由员工个人签署的，但发票的抬头仍然应该根据实际付款方来确定。如果房费最终是由单位支付，且单位要求将发票开给其作为报销凭证，那么销售方（如房东或房屋租赁公司）应当按照单位的要求开具发票。

此外，还需要注意的是，发票的开具必须遵循如实开具的原则。这意味着发票上的内容必须与实际经营业务情况相符，不得虚开或开具与实际业务不符的发票。因此，在开具发票时，销售方需要仔细核对合同、付款记录等相关资料，确保发票的抬头、内容、金额等信息准确无误。

针对您提到的具体案例，如果您外出学习租房结束后要开具发票由单位报销，且房费最终是由单位支付，那么根据发票管理办法的规定以及实际业务操作原则，发票的抬头应该为单位名称。如果闽侯县税务局因为您个人和房东签署了租房合同而拒绝开具以单位名称开头的发票，这可能存在误解或操作不当的情况。您可以进一步与税务局沟通，提供单位付款的相关证明资料，以争取开具符合实际业务情况的发票。

最后，如果在实际操作中遇到任何疑问或困难，建议您携带相关交易资料前往主管税务机关进行进一步核实和咨询。税务机关会根据您的具体情况和法律法规的要求，为您提供准确、详细的解答和指导。