开票主体和合同主体在一般情况下应当保持一致，但并非在所有情况下都必须严格一致，这主要取决于具体的交易情境、合同条款以及相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、开票主体与合同主体一致性的重要性
税务合规性：发票是买卖双方交易的重要凭证，也是税务机关进行税务管理和征收税款的重要依据。如果开票主体与合同主体不一致，可能会引发税务部门的关注，甚至被视为逃税或漏税行为，从而面临税务调查和处罚。
合同纠纷处理：在发生合同纠纷时，依据合同相对性原则，诉讼主体通常是合同相对方。如果开票主体与合同主体不一致，可能会导致在纠纷处理中面临法律上的障碍。
交易真实性验证：开票主体与合同主体的一致性有助于验证交易的真实性和合法性，保护交易双方的权益。
二、开票主体与合同主体不一致的特殊情况
合同特别约定：如果合同中有明确约定开票主体可以与合同主体不一致，并且这种约定不违反相关法律法规，那么在这种情况下，开票主体与合同主体不一致是可以接受的。
关联方或受托方开票：如果开票主体是合同主体的关联方或受托方，并且能够提供相关证明文件说明其有权代合同主体开具发票，那么在这种情况下，开票主体与合同主体不一致也是可以被接受的。
实际交易主体与开票主体分离：在某些特殊情况下，如实际交易主体因特殊原因无法直接开具发票，而需要由其他主体代为开具，且这种代开行为符合相关法律法规的规定，那么开票主体与实际交易主体（可能也是合同主体）的不一致也是可以被允许的。但这种情况需要特别谨慎处理，以避免涉及虚开发票等违法行为。
三、处理建议
审查合同条款：在签订合同时，应明确约定开票主体，以避免后续因开票主体与合同主体不一致而引发的纠纷。
提供证明文件：如果开票主体与合同主体不一致，应提供相关证明文件说明其有权代合同主体开具发票，以确保交易的合法性和真实性。
咨询专业人士：在处理开票主体与合同主体不一致的问题时，建议咨询税务或法律专业人士的意见，以确保合规操作并降低法律风险。
总结：开票主体和合同主体在一般情况下应当保持一致，以确保税务合规性、合同纠纷处理的顺畅性以及交易真实性的验证。然而，在特定情况下，如合同特别约定、关联方或受托方开票等，开票主体与合同主体不一致也是可以被接受的。但无论如何处理，都应确保交易的合法性和真实性，并咨询专业人士的意见以降低法律风险。