当借条过了还款日期，但借款人仍在陆续还款时，作为债权人，你可以按照以下步骤来妥善处理这一问题，以确保你的权益得到充分保障：
一、友好沟通，了解还款情况
首先，与借款人进行友好沟通，了解其仍在陆续还款的具体原因和当前的财务状况。这有助于你更好地理解借款人的还款能力和意愿，为后续的处理提供参考。
二、确认还款计划与协议
重新约定还款计划：如果借款人表示有还款意愿但暂时资金困难，你可以与其协商达成新的还款计划，明确新的还款日期、方式及条件。例如，可以约定分期还款，并明确每期的还款金额和时间。
签订补充协议：为了确保债权债务关系的清晰，建议与借款人签订补充协议，进一步确认债务金额、已过期还款日期、新的还款安排以及违约责任等条款。这有助于在后续处理中提供明确的法律依据。
三、保留催款证据，确保诉讼时效
书面催款通知：即使借款人仍在陆续还款，你也应通过邮件、信函或律师函等书面形式发送催款通知，明确指出借款金额、已逾期天数、已还款金额及剩余未还款金额，并要求借款人按照新的还款计划履行还款义务。同时，保留好寄送凭证，以备后续作为证据使用。
电子通讯记录：如果利用短信、微信等电子通讯方式与借款人沟通催款事宜，确保聊天记录完整，包含借款的关键信息，如借款金额、还款日期、已还款金额等。这些记录也可以作为后续处理中的证据。
注意诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，你应确保在诉讼时效内主张权利，否则可能面临败诉风险。如果借款人仍在陆续还款，但还款计划不明确或存在争议，建议及时咨询专业律师，以了解如何中断诉讼时效或采取其他法律措施。
四、考虑法律途径，维护自身权益
申请支付令：如果债权债务关系明确且合法，且借款人未按照新的还款计划履行还款义务，你可以向基层人民法院申请支付令。支付令是一种快速高效的催款方式，如果借款人在收到支付令后未在规定时间内提出异议或履行还款义务，你可以直接向法院申请强制执行。
提起诉讼：如果协商和支付令均无效，或者借款人明确表示拒绝履行还款义务，你应准备充分的证据材料（如借条、转账记录、催款记录、补充协议等），向人民法院提起民事诉讼。在诉讼过程中，你需要如实陈述案件事实并提供相关证据，以支持你的诉讼请求。
五、执行判决，实现债权
如果法院判决你胜诉，但借款人仍不履行还款义务，你可以在规定时间内向法院申请强制执行。法院将依法对借款人的财产采取查封、冻结或拍卖等措施，强制其履行还款责任。在执行过程中，你需要配合法院的工作，提供必要的协助和信息，以确保执行工作的顺利进行。
六、注意事项
通过以上步骤，你可以系统地处理借条过了还款日期但借款人仍在陆续还款的问题，既保障了自身的合法权益，又遵循了法律法规的要求。