施工单位项目经理人证分离的处罚需根据具体违法情形及后果，结合行政、民事、刑事责任综合判定，具体如下：

1. 行政处罚：责令改正+罚款+市场禁入
   根据《建筑施工企业主要负责人、项目负责人和专职安全生产管理人员安全生产管理规定》第27条，若项目经理未履行安全生产管理职责（如人证分离导致现场管理失控），住建部门可责令限期改正，处1万元以下罚款；逾期未改的，责令停业整顿，并处1万-3万元罚款。
   若涉及“挂证”行为（即项目经理将证书出借给其他单位使用），根据《注册建造师管理规定》第34条，住建部门可责令改正，没收违法所得，处违法所得3倍以下且不超过3万元的罚款；情节严重的，吊销执业资格证书，5年内不予注册。

2. 民事赔偿：连带责任风险
   若人证分离导致工程质量、安全事故，项目经理作为直接责任人，可能需与施工单位承担连带赔偿责任。例如，《民法典》第1191条规定，用人单位工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任；若项目经理存在故意或重大过失，用人单位可向其追偿。

3. 刑事责任：重大事故罪风险
   若人证分离引发重大安全事故（如死亡1人以上或重伤3人以上），项目经理可能涉嫌《刑法》第134条“重大责任事故罪”，处3年以下有期徒刑或拘役；情节特别恶劣的，处3-7年有期徒刑。司法实践中，是否实际参与现场管理是认定罪责的关键因素。

实务建议：

• 施工单位应严格落实项目经理到岗履职制度，通过人脸识别、定位打卡等技术手段确保人证合一；
  
• 项目经理需拒绝“挂证”行为，避免因他人违规使用证书而承担法律责任；
  
• 若已发生人证分离情形，应立即整改并主动向监管部门报告，降低处罚风险。
  

如有具体案件细节（如是否发生事故、证书使用方式等），可进一步向我咨询，我会结合证据材料提供针对性分析。