正式员工自离是有工资的，但具体工资发放情况可能因公司规定、劳动合同约定以及实际情况而有所不同。以下是对此问题的详细分析：

一、自离后工资的支付原则

1. 按实际出勤结算：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，自离员工应按实际工作天数获得相应报酬，这包括基本工资、绩效奖金及加班费等已产生的收入。

2. 扣除合理费用需合规：

   • 用人单位在支付工资时，可以依法扣除因员工未结工作交接造成的损失、培训违约金（在约定范围内）等费用。但这些扣除必须符合法定条件，并提供相应的证据支撑。未经协商的罚款、押金等扣费行为均属违法。

二、自离对工资发放的潜在影响及处理方式

1. 工资延迟发放风险：

   • 部分企业可能以“未完成离职手续”为由暂缓发放工资。但根据法律规定，这种暂缓期限不得超过一个工资支付周期。若超期未付，劳动者有权通过劳动仲裁主张双倍工资差额。

2. 经济损失赔偿争议：

   • 若员工未提前通知离职，可能导致企业遭受临时用工成本增加、项目延误等损失。此类赔偿金额需经司法程序认定，且通常不超过劳动者月工资的20%。若扣除赔偿后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

3. 社保公积金处理差异：

   • 自离当月，社保公积金可能因未及时减员而产生个人承担部分费用，具体由地方政策决定。建议离职前与企业确认费用缴纳截止时间，以避免后续补缴纠纷。

三、法律建议与维权途径

1. 对于员工：

   • 在离职前，尽量与公司沟通协商，按照法定程序和公司规定办理离职手续，以确保工资的顺利结算。
   • 若遭遇公司拒绝支付工资或违法克扣工资的情况，可以向当地劳动保障部门（如劳动监察大队）投诉，或向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

2. 对于公司：

   • 应建立健全的工资支付制度和离职管理制度，确保员工离职时能够顺利结算工资。
   • 在处理员工自离造成的经济损失时，应遵循相关法律法规，合理合法地要求赔偿，并避免违法扣费行为。

综上所述，正式员工自离时，公司仍有义务支付其应得的工资。但具体工资发放情况可能因多种因素而有所不同。因此，在处理此类问题时，建议双方均遵循法律法规，通过沟通协商或法律途径妥善解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。