结论：债权人未申报债权而是直接起诉并经法院判决后，管理人不能直接依据法院判决确认债权，但需根据具体情况进行审查和处理。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：债权申报与法院判决的关系
在破产程序中，债权人申报债权是参与破产程序并主张权利的前提步骤。根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，债权人应当在人民法院确定的债权申报期限内向管理人申报债权。若债权人未依法申报债权，则不得依照该法规定的程序行使权利，这包括参与破产财产的分配等。
法院判决是债权人通过诉讼程序获得的法律文书，它确认了债权人与债务人之间的债权债务关系。然而，在破产程序中，法院判决并不直接等同于管理人对债权的确认。管理人需要依据破产法的规定，对债权人申报的债权进行审查，并编制债权表，提交债权人会议核查。
二、管理人处理法院判决债权的步骤
审查法院判决：管理人首先需要审查债权人提交的法院判决，确认判决的真实性、合法性和有效性。这包括确认判决是否已生效、判决内容是否明确等。
对比申报情况：管理人会将法院判决与债权人申报的债权情况进行对比。如果债权人未申报债权而直接起诉，管理人需要核实债权人是否在破产程序中享有申报债权的权利，以及是否因未申报而丧失了某些权利。
组织债权人会议核查：管理人会将审查后的债权表提交债权人会议核查。债权人、债务人对债权表记载的债权无异议的，由人民法院裁定确认。如果债权人或债务人对债权表记载的债权有异议，可以向受理破产申请的人民法院提起诉讼。
三、特殊情况下的处理
补充申报债权：如果债权人在破产财产最后分配前补充申报债权，且管理人对其债权予以确认，则债权人可依据确认结果参与分配。但在此情况下，债权人仍需遵循破产法的规定，先向管理人申报债权，再参与分配。
法院判决与破产程序的关系：如果债权人通过诉讼获得了胜诉判决，但由于未经过破产程序的债权确认和清偿顺序安排，其债权可能无法得到实际清偿。因此，即使债权人获得了法院判决，也需要按照破产法的规定向管理人申报债权，以便参与破产财产的分配。
四、法律建议
及时申报债权：对于涉及破产程序的债权，债权人应及时向管理人申报债权，以确保自己的权益得到保障。
遵循法律程序：债权人应遵循破产法的规定，通过合法途径主张自己的权利。如果债权人未申报债权而直接起诉，可能会面临程序障碍和实体权利受限的风险。
咨询专业律师：在处理复杂的债权问题时，债权人可以咨询专业律师，以获得更全面、准确的法律建议。不过，作为孙逊律师，我随时准备为你提供法律咨询，你可以直接向我提问。
总结：债权人未申报债权而是直接起诉并经法院判决后，管理人不能直接依据法院判决确认债权。管理人需要依据破产法的规定对债权进行审查，并组织债权人会议核查。债权人应遵循法律程序，及时申报债权，并在必要时咨询专业律师以维护自己的权益。