结论前置：公章未经备案，合同在符合相关法律条件下通常有效。但若涉及违法行为或合同相对人有合理怀疑且能证明，则合同效力可能存在问题。以下从不同角度进行详细分析：
一、合同有效的条件
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的效力主要取决于当事人的真实意思表示以及是否违反法律法规的强制性规定，而非公章是否备案。
具体条件：
- 行为人（即合同双方）具有相应的民事行为能力；
- 合同双方的意思表示真实；
- 合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
分析说明：
- 只要签订合同的双方满足上述条件，即便使用的是未备案的公章，合同依然有效。因为合同的本质在于双方的真实意愿和合法内容，公章的形式要求并非决定性因素。例如，双方在实际交易中，即使公章未备案，但双方均认可合同内容，且合同内容合法，那么该合同即具有法律效力。
二、可能导致合同效力存在问题的情况
涉及违法行为：
- 法律依据：《中华人民共和国治安管理处罚法》及《中华人民共和国刑法》对伪造、私刻公章等违法行为有明确规定。
- 具体分析：如果公章未备案是因为存在伪造、私刻等违法行为，那么使用该公章签订的合同效力会受到影响。因为这种行为本身违法，可能导致合同被认定为无效，特别是当签订合同的行为并非当事人真实意思表示，或者损害了国家、集体或第三人的合法权益时。例如，若一方使用伪造的公章签订合同，以骗取对方财物，该合同即可能因违法行为而被认定为无效。
相对人有合理怀疑：
- 法律依据：《中华人民共和国民法典》关于欺诈行为的规定。
- 具体分析：如果合同相对人有合理理由怀疑公章的真实性和有效性，并且能够证明自己在签订合同时已经尽到了合理的审查义务，但仍然无法确认公章的合法性，那么合同的效力可能会处于不确定状态。此时，相对人可能会依据法律规定请求撤销合同。例如，若合同相对方在签订合同时发现公章未备案，且对方无法提供合法证明，相对方有权请求撤销合同。
三、建议与防范措施
公章备案：
- 为了避免后续可能出现的纠纷或法律风险，建议企业在使用公章前进行备案，并妥善保管和使用公章。公章备案是企业管理的重要环节，有助于确保公章的合法性和有效性。
附加证据：
- 如果确实存在公章未备案的情况，建议在签订合同时，附加其他能够证明合同真实性和有效性的证据，如签字、盖章过程的视频记录，或者通过公证等方式增强合同的法律效力。这些附加证据可以在合同纠纷发生时，为合同的有效性提供有力支持。
谨慎审查：
- 合同相对方在签订合同时，应谨慎审查对方公章的真实性和有效性。如果发现公章未备案或存在其他疑点，应及时要求对方提供合法证明或采取其他措施以降低法律风险。
综上所述，公章未经备案并不直接决定合同的效力。关键在于合同本身的内容是否合法、双方的意思表示是否真实以及是否存在违法行为或合理怀疑。因此，在实际操作中，应综合考虑各种因素来判断合同的效力，并采取必要的防范措施以降低法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。