结论：合同中约定“签名且加盖印章后生效”，但实际仅有印章没有签名时，合同是否生效需分情况讨论，一般情况下合同不生效，但存在例外情形。以下为详细分析：
一、合同生效的一般原则与约定条款的效力
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时生效，但法律另有规定或者当事人另有约定的除外。在您所描述的情况中，合同中明确约定了“签名且加盖印章后生效”，这是当事人对合同生效条件的特别约定，具有法律约束力。因此，从原则上讲，只有同时满足签名和加盖印章两个条件，合同才能生效。
二、仅有印章没有签名时合同的效力分析
严格遵循约定原则：
- 如果严格按照合同中的约定来执行，那么仅有印章没有签名的情况下，合同并未满足生效条件，因此合同不生效。
例外情形分析：
- 印章的真实性与合法性：如果加盖的印章是真实的、合法的，并且能够代表合同一方的真实意愿，同时另一方对此也予以认可，那么在实际操作中，法院或仲裁机构可能会根据具体情况，结合其他证据，认定合同已经生效。但这种情况需要充分的证据支持，并且不是普遍适用的原则。
- 合同履行情况：如果合同已经实际履行，且双方对合同内容没有异议，那么即使合同上仅有印章没有签名，也可能被视为双方对合同内容的认可，从而认定合同已经生效。但这种情况同样需要具体的证据来支持。
- 表见代理或职务行为：如果加盖印章的行为构成表见代理或职务行为，即行为人虽然没有签名，但其加盖印章的行为足以让相对人相信其有权代表合同一方签订合同，那么合同也可能被认定生效。但这需要满足一定的法律条件，并且需要具体的证据来证明。
三、法律建议与风险提示
严格遵守合同约定：
- 为了避免不必要的法律纠纷，建议当事人在签订合同时，严格遵守合同中的约定，确保合同同时满足签名和加盖印章两个条件。
完善合同条款：
- 在合同中可以明确约定，如果因特殊原因无法同时满足签名和加盖印章的条件时，如何处理（例如，可以通过传真、电子邮件等方式进行确认）。
保留相关证据：
- 在合同签订和履行过程中，建议当事人保留好相关证据，如合同文本、往来函件、付款凭证等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
及时寻求法律帮助：
- 如果因合同生效问题发生纠纷，建议当事人及时寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
最后，合同中的生效条款具有法律约束力，当事人应当严格遵守。如果在实际操作中遇到特殊情况，建议根据具体情况结合相关法律规定和证据来综合判断合同的效力。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。