针对您提出的“庙宇占用企业用地怎么办”的问题，我们可以从以下几个方面来分析和解答：
首先，我们需要明确庙宇占用企业用地的性质。庙宇作为宗教活动场所，其使用的土地应当遵循相关的法律法规进行申请和登记。根据相关规定，宗教团体、宗教活动场所所有的房屋和使用的土地，应当依法向县级以上地方人民政府房产、土地管理部门申请登记，并领取所有权、使用权证书。这意味着，如果庙宇确实占用了企业的用地，那么它应当具备相应的土地使用权证书或相关证明文件。
接下来，我们考虑企业方面的权益。如果企业发现自己的用地被庙宇占用，且庙宇没有合法的土地使用权，那么企业可以采取以下措施：
与庙宇方面沟通：首先尝试与庙宇方面进行沟通，了解占用的原因和背景，看是否能够通过友好协商解决问题。
查阅相关法律法规：企业应查阅相关的土地法律法规，了解自己的权益和庙宇方面应当遵循的规定，为后续的行动提供法律依据。
向相关部门反映：如果沟通无果，企业可以向当地的土地管理部门或相关部门反映情况，请求他们介入调查并处理此事。
寻求法律援助：如果问题较为复杂或涉及较大的利益纠纷，企业可以寻求专业的法律援助，通过法律途径来维护自己的权益。
另外，值得一提的是，《公共文化服务保障法》中明确规定了公共文化设施的建设用地应当符合土地利用总体规划和城乡规划，并依照法定程序审批。虽然庙宇不属于公共文化设施，但这一法规也强调了土地使用的合法性和规划性。因此，在处理庙宇占用企业用地的问题时，我们也应当考虑到土地使用的合法性和规划性。
综上所述，处理庙宇占用企业用地的问题需要综合考虑多个方面，包括庙宇的土地使用权、企业的权益以及相关的法律法规。建议企业在发现此类问题时，及时采取行动，通过与庙宇方面沟通、查阅相关法律法规、向相关部门反映以及寻求法律援助等方式来维护自己的权益。