核心结论：若签合同时不懂所签的合作协议，可先仔细阅读协议内容，对有疑问处做好标记；再通过多种途径弄清楚疑问点；若仍不放心，可采取一些保障自身权益的措施。以下是详细说明：

1. 仔细阅读协议内容
   • 通读协议：拿到合作协议后，不要急于签字，先找一个安静、不受干扰的环境，从头到尾认真阅读协议的每一个条款。合作协议通常包含了合作双方的权利义务、合作期限、收益分配、违约责任等重要内容，全面了解这些信息是理解协议的基础。
   • 标记疑问点：在阅读过程中，对于不理解的专业术语、模糊的表述或者觉得不合理的条款，用笔做好标记。比如，协议中提到的“不可抗力”具体指哪些情况，收益分配的计算方式是否清晰明确等。
2. 弄清楚疑问点
   • 自行查询：对于一些常见的法律术语和概念，可以通过互联网搜索相关的法律解释和案例。例如，对于“违约责任”的理解，可以在法律专业网站或者政府部门的法律普及平台上查找相关资料，了解违约责任的常见形式和承担方式。
   • 向对方询问：如果自行查询后仍有疑问，或者协议中的某些条款涉及到对方的特殊规定和解释，可以直接向合作方提出询问。要求对方对疑问点进行详细、清晰的解释，确保自己真正理解协议的内容。在询问时，可以要求对方以书面形式回复，以便留存证据。
   • 请教专业人士：如果协议内容比较复杂，涉及到多个法律领域或者涉及金额较大，可以请教有经验的法律人士，比如律师。律师具有专业的法律知识和丰富的实践经验，能够对协议进行全面的审查和分析，指出其中可能存在的风险和问题，并提供相应的解决方案。
3. 保障自身权益
   • 协商修改协议：如果在理解协议的过程中发现某些条款对自己不利或者存在不合理之处，可以与合作方进行协商，要求对协议进行修改。在协商时，要以客观、理性的态度提出自己的意见和要求，并提供合理的依据和解释。例如，如果协议中的违约责任条款对己方过于苛刻，可以要求适当调整违约责任的承担方式和比例。
   • 补充协议：对于一些在原协议中没有明确约定或者约定不明确的事项，可以与合作方签订补充协议。补充协议是对原协议的进一步完善和补充，能够更好地保障双方的权益。比如，在合作过程中可能会出现一些新的情况和问题，如合作项目的变更、合作期限的延长等，可以通过补充协议对这些事项进行明确约定。
   • 留存证据：在整个签订协议的过程中，要注意留存相关的证据，如与对方的沟通记录、协议的修改稿、补充协议等。这些证据在日后如果发生纠纷时，能够起到重要的作用，帮助自己维护合法权益。例如，如果与合作方在协议条款的理解上存在争议，可以通过沟通记录来证明自己的理解和主张。

如果你在处理合作协议过程中还有任何疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供详细、专业的解答。