“违约金千分之五”这一约定通常直接来源于合同双方当事人在合同中的具体条款设定，并非直接出自某一特定的法律法规。以下是对这一问题的详细解释：
一、合同中的约定
自主约定原则：在合同法领域，违约金的设定通常遵循自主约定原则。这意味着合同双方当事人可以根据合同的性质、目的、交易习惯以及双方的谈判地位等因素，在合同中自由约定违约金的数额或计算方式。因此，“违约金千分之五”这样的具体比例，很可能是双方当事人在合同中经过协商后达成的共识。
合同条款示例：假设在一个买卖合同中，双方约定：“如买方未按约定时间支付货款，应按未支付金额的千分之五向卖方支付违约金。”这样的条款就明确规定了违约金的计算方式和比例。
二、法律对违约金的限制
虽然违约金的设定遵循自主约定原则，但法律也对违约金的数额进行了一定的限制，以防止一方利用优势地位设定过高的违约金，从而损害另一方的利益。
违约金过高或过低的调整：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少；如果约定的违约金过分低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当增加。这意味着，虽然合同双方可以约定违约金的比例，但如果该比例过高或过低，法律将进行干预和调整。
实际损失为参考：在判断违约金是否过高或过低时，法院或仲裁机构通常会以实际损失为参考。如果违约金数额明显高于实际损失，可能会被视为过高；如果违约金数额明显低于实际损失，则可能会被视为过低。
三、实际应用中的考虑
合同性质与目的：在设定违约金时，合同双方应充分考虑合同的性质和目的。例如，在一份涉及重大经济利益的合同中，双方可能会设定较高的违约金比例以保障合同的严肃性和双方的权益；而在一份日常交易合同中，双方可能会设定较低的违约金比例以体现灵活性和公平性。
谈判地位与公平性：合同双方在设定违约金时，还应考虑各自的谈判地位和公平性。如果一方处于明显优势地位，可能会试图设定过高的违约金比例以压迫另一方；而另一方则应通过谈判和协商来争取更合理的违约金比例。
举例说明：
假设在一个房屋租赁合同中，双方约定：“如承租人未按约定时间支付租金，应按未支付租金的千分之五向出租人支付违约金。”如果承租人未支付10,000元租金，那么按照千分之五计算的违约金就是：
\(10,000 \times 0.5\% = 10,000 \times 0.005 = 50\)元
这样的计算方式既体现了合同双方的自主约定原则，又符合法律对违约金的限制要求。
总结与建议：
“违约金千分之五”这一约定通常直接来源于合同双方当事人在合同中的具体条款设定。在设定违约金时，合同双方应充分考虑合同的性质、目的、谈判地位以及公平性等因素，并遵循法律对违约金的限制要求。如果您在合同中遇到了关于违约金的问题或纠纷，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。