结论：能否追回中间商多开的5万元，关键在于该行为的性质及是否构成不当得利或欺诈，同时需考虑证据的充分性。以下从不同角度进行分析：
一、若中间商多开5万元构成不当得利
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不当得利是指一方在没有合法依据的情况下获得利益，而另一方因此遭受损失的法律现象。在此情况下，受损方有权要求得利方返还其所得利益。
分析：
- 如果中间商在开具发票或结算时，故意多开了5万元，且没有合法依据（如双方并未约定此额外费用），则这5万元构成不当得利。
- 公司作为受损方，有权要求中间商返还这5万元。
建议：
- 公司应收集相关证据，如合同、发票、结算单等，以证明中间商多开了5万元。
- 与中间商进行协商，要求其返还多开的款项。
- 如果协商无果，公司可以向法院提起诉讼，要求中间商返还不当得利。
二、若中间商多开5万元构成欺诈
法律背景：
- 欺诈是指一方故意告知对方虚假情况，或者故意隐瞒真实情况，诱使对方作出错误意思表示的行为。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，欺诈行为可能构成诈骗罪，如果数额较大，还可能面临刑事处罚。
分析：
- 如果中间商在交易过程中，通过虚构事实或隐瞒真相的方式，故意多开了5万元，且意图非法占有这5万元，则可能构成欺诈。
- 公司作为受害方，不仅有权要求中间商返还多开的款项，还有权要求其承担因欺诈行为造成的其他损失。
建议：
- 公司应立即收集证据，包括合同、发票、结算单、沟通记录等，以证明中间商的欺诈行为。
- 向公安机关报案，要求追究中间商的刑事责任。
- 同时，可以向法院提起民事诉讼，要求中间商返还多开的款项并赔偿损失。
三、证据收集与诉讼准备
证据收集：
- 无论是不当得利还是欺诈，证据都是关键。公司应尽可能收集所有与交易相关的证据，包括书面合同、发票、结算单、银行转账记录、沟通记录等。
- 如果可能的话，还可以收集证人证言或录音录像等证据，以进一步证明中间商的行为。
诉讼准备：
- 在提起诉讼前，公司应咨询专业律师，了解诉讼流程和可能的风险。
- 准备充分的诉讼材料，包括起诉状、证据清单、代理词等。
- 考虑是否需要申请财产保全或证据保全等措施，以确保诉讼的顺利进行。
后续思考依据：在处理此类纠纷时，公司应首先明确中间商多开5万元的性质，是构成不当得利还是欺诈。然后，根据具体情况收集证据并采取相应的法律措施。如果公司对法律程序不熟悉或担心风险，可以直接向我咨询，我会根据公司的具体情况提供专业的法律建议。