结论：被违法辞退一年后确诊尘肺病二期，两年后能否恢复劳动关系并补发工资，需分情况讨论，主要取决于是否超过法定时效以及是否满足恢复劳动关系的条件。
一、关于恢复劳动关系
时效问题：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。若被违法辞退后，劳动者未在一年内申请仲裁要求恢复劳动关系，则可能因超过时效而丧失胜诉权。
- 在您的情况下，被违法辞退已过去一年，且确诊尘肺病二期又过去了两年，从时间上看，很可能已经超过了申请仲裁的时效期间。但需注意，若存在时效中断或中止的情形（如因不可抗力或其他正当理由耽误），则时效可能重新计算或延长。
恢复劳动关系的条件：
- 即使未超过时效，恢复劳动关系还需满足一定条件，如用人单位是否仍存在、原岗位是否仍存在、劳动者是否仍具备从事原岗位工作的能力等。
- 对于尘肺病二期患者，若因病情严重无法从事原工作，且用人单位无法提供其他适合的岗位，则恢复劳动关系可能面临实际困难。
二、关于补发工资
工资补发的前提：
- 补发工资的前提是劳动关系得到恢复。若劳动关系无法恢复，则补发工资的请求可能无法得到支持。
- 若劳动关系得到恢复，且劳动者在违法辞退期间未从事其他工作，则有权要求用人单位补发违法辞退期间的工资。
工资补发的计算：
- 工资补发的计算通常基于劳动者在违法辞退前的平均工资水平，乘以违法辞退的期间（即应发工资而未发的月份数）。
- 具体计算公式为：补发工资 = 平均工资 × 违法辞退期间月份数。但需注意，若劳动者在违法辞退期间已从事其他工作并获得收入，则这部分收入可能需从补发工资中扣除。
三、综合建议
尽快申请仲裁或提起诉讼：
- 鉴于您的情况可能已超过申请仲裁的时效期间，建议您尽快咨询专业律师，评估是否存在时效中断或中止的情形，以及是否有可能通过其他途径（如协商、调解）解决争议。
- 若时效问题无法解决，您仍可考虑提起诉讼，但需做好可能因超过时效而败诉的心理准备。
收集证据：
- 无论选择何种途径解决争议，收集证据都是关键。您应尽可能收集与违法辞退、尘肺病诊断、工资水平等相关的证据材料，以支持您的主张。
关注身体健康：
- 在处理法律争议的同时，您也应关注自己的身体健康状况。尘肺病是一种严重的职业病，需要得到及时的治疗和康复。
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