公司事假扣补助金是否合法，主要取决于公司的规章制度以及劳动合同的约定。以下从不同角度为你详细分析：
合法情形
规章制度或劳动合同有明确规定：
- 若公司在依法制定并公示的规章制度中明确规定，员工请事假期间会扣除相应补助金，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，则公司按照此规定执行是合法的。
- 同样，若劳动合同中明确约定了事假期间补助金的扣发情况，且该约定合法有效，公司也有权按照约定执行。
补助金与出勤挂钩：
- 如果补助金的性质与员工的工作表现、出勤情况等紧密相关，且员工请事假直接影响了其出勤率，进而影响了补助金的发放，那么公司扣除相应补助金也是合理合法的。例如，某些公司设置的全勤奖或出勤补贴，其发放条件就是员工必须满足一定的出勤要求。
不合法情形
无明确规定或约定：
- 若公司既没有在规章制度中规定事假要扣补助金，也没有在劳动合同中与员工进行约定，却随意扣除员工补助金，则属于违法行为。员工有权要求公司补发被扣除的补助金，并可能通过法律途径维护自己的合法权益。
规章制度不合法或不合理：
- 若公司制定的涉及事假扣补助金的规章制度不符合法律规定的制定程序（如未经职工代表大会或全体职工讨论、未公示等），或内容违反法律法规的强制性规定（如显失公平、损害员工合法权益等），则以此为依据扣除补助金也是不合法的。员工同样有权要求公司纠正违法行为，并补发被扣除的补助金。
实际操作建议
了解公司规定：
- 员工在请事假前，应详细阅读并了解公司关于事假扣发补助金的具体规定，以避免产生误解和纠纷。如果对公司规定有疑问或不满，可以及时向公司人力资源部门或相关负责人咨询或提出异议。
审查规章制度与劳动合同：
- 员工应审查公司规章制度或劳动合同中关于事假期间扣发补助金的规定是否合法、合理。如果认为公司的规定侵犯了自己的合法权益，可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等方式进行维权。
保留证据：
- 在请假过程中，员工应妥善保留相关证据，如请假申请单、批准记录、工资条等，以便在发生争议时能够证明自己的权益。这些证据将有助于员工在维权过程中占据有利地位。
综上所述，公司事假扣补助金是否合法并非一概而论的问题，而是需要根据公司的规章制度以及劳动合同的约定来判断。员工在请假前应充分了解公司规定，并在必要时寻求法律援助以维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。