仅公司通过微信转账发工资这一行为，不能直接确认劳动关系，但可以作为确认劳动关系的重要证据之一。以下从不同角度为你详细分析：

从法律规定角度

根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号）规定，用人单位招用劳动者未订立书面劳动合同，但同时具备下列情形的，劳动关系成立：

1. 用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格：比如公司是依法注册登记的企业，你是具有劳动权利能力和劳动行为能力的自然人。
2. 用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动：如果公司通过微信给你安排工作任务、对你进行工作考勤管理，你按照公司要求完成工作，公司通过微信转账支付工资，这符合该情形。
3. 劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分：例如你从事的工作是公司主营业务所必需的环节。

微信转账发工资只是“有报酬的劳动”中支付报酬这一环节的体现，单独来看不能直接证明劳动关系，但结合其他证据，如工作安排记录、考勤记录等，有助于确认劳动关系。

从证据效力角度

微信转账记录属于电子数据证据，在确认劳动关系纠纷中具有一定的证明力。不过，它也存在一些局限性：

1. 主体难以明确：微信转账记录仅显示转账双方微信昵称，难以直接确定对方就是公司。如果公司使用个人微信转账，还需要进一步证明该微信账号与公司之间的关联性，比如公司出具的情况说明、该微信账号在公司的工作群中的身份等。
2. 款项性质不明：转账记录只能显示有资金往来，但不能直接证明该款项就是工资。有可能存在其他经济往来，如借款、报销款等。需要结合其他证据，如聊天记录中关于工资的约定、工资条等，来证明款项性质。

实务建议

如果你希望通过微信转账记录确认劳动关系，建议你采取以下措施：

1. 收集其他证据：除了微信转账记录外，尽量收集其他能够证明劳动关系的证据，如工作证、工作服、考勤记录、工作安排记录、与上级或同事的聊天记录等。
2. 固定证据：对微信聊天记录、转账记录等进行截图或录屏保存，并确保记录的完整性和真实性。如果可能，可以将相关证据进行公证，以增强其证明力。
3. 与公司协商或申请仲裁：如果与公司就劳动关系确认问题产生争议，可以先尝试与公司协商解决。如果协商不成，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，在仲裁过程中提交你收集的证据，以维护自己的合法权益。

如果你在确认劳动关系方面还有其他疑问，或者遇到了相关的法律问题，都可以直接向我咨询。