结论前置：在检察院处理的案件中，确实存在一人起诉而另外两人可以不起诉的情况。这主要取决于每个人的具体行为、责任大小以及涉案情节的严重程度，检察机关会根据事实和法律，对每个人作出是否起诉的决定。
1. 法定不起诉的情形
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，存在以下情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
在共同犯罪案件中，如果部分犯罪嫌疑人符合上述情形之一，检察机关将依法对其作出法定不起诉决定。例如，如果其中一人只是轻微参与，且情节显著轻微，不构成犯罪，那么检察机关就可能对其不起诉。
2. 酌定不起诉的情形
依据《刑事诉讼法》第一百七十七条第二款的规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。在共同犯罪中，各犯罪嫌疑人的作用、参与程度、悔罪表现等可能存在差异。对于那些虽然参与了犯罪行为但情节轻微、有悔罪表现的犯罪嫌疑人，检察机关可能会综合考虑各种因素后，对其作出酌定不起诉决定。比如，其中两人可能只是从犯，且认罪态度好，有悔罪表现，那么检察机关就可能对他们不起诉。
3. 证据不足不起诉的情形
根据《刑事诉讼法》第一百七十五条第四款的规定，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。在共同犯罪案件的侦查过程中，若针对部分犯罪嫌疑人的证据收集困难，无法形成完整的证据链，且经过两次补充侦查后证据仍然不足，检察机关将依法对其作出证据不足不起诉的决定。例如，如果其中两人的犯罪证据确实不足，无法证明他们参与了犯罪，那么检察机关就可能对他们不起诉。
综合分析：
检察机关在审查案件时，会严格遵循法律规定和事实依据，对每个涉案人员作出公正、合理的处理决定。在同一案件中，多人被不起诉的情况并非罕见，而是基于每个人的具体行为和涉案情节的不同而作出的差异化处理。这种处理方式既体现了法律的公正性，也符合司法实践中的实际情况。
因此，如果你或你身边的人遇到了类似的情况，不必过于担心或焦虑。检察机关会依法对每个涉案人员进行审查和处理，确保司法的公正性和合理性。如果你有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律意见和帮助。