结论前置：公司申请专精特新（我理解您可能想表达的是“专精特新”企业认定，以下均以此为准）使用您的身份证，确实可能对您产生一定影响，具体影响取决于身份证的使用方式和目的。以下从不同角度为您详细分析：
一、身份证作为身份证明文件的重要性
身份证是公民的重要身份证明文件，包含了个人基本信息、照片等敏感信息。根据《中华人民共和国居民身份证法》的相关规定，身份证不得出租、出借、转让，也不得冒用他人身份证或者使用骗领的身份证。因此，任何未经您同意使用您身份证的行为，都可能构成违法。
二、公司申请专精特新使用您身份证的可能情况及影响
作为公司员工或股东身份使用：
- 如果公司是为了证明您是其员工或股东，以便在申请专精特新企业认定时满足相关条件（如员工数量、股东结构等），且您确实同意并知晓此事，那么这种使用方式在合法合规的前提下，对您的影响相对较小。但您仍需关注公司是否会滥用您的身份信息，以及是否会因此产生不必要的法律责任。
- 风险点：若公司存在违法违规行为，如虚假申报、骗取补贴等，您作为名义上的员工或股东，可能会因身份被滥用而卷入法律纠纷。
作为公司法定代表人或高管身份使用：
- 如果公司试图使用您的身份证来注册为法定代表人或高管，以便在申请专精特新企业认定时提升公司形象或满足特定条件，这种行为风险极高。因为法定代表人或高管需要承担公司运营过程中的法律责任，包括但不限于债务承担、违法处罚等。
- 风险点：您可能会因公司违法行为而承担个人法律责任，如被列入失信被执行人名单、限制高消费等。
未经您同意擅自使用：
- 如果公司未经您同意，擅自使用您的身份证进行专精特新企业认定申请，这种行为不仅违法，而且可能对您造成严重后果。您有权要求公司立即停止使用您的身份证，并可以向相关部门举报公司的违法行为。
- 风险点：您的身份信息可能被泄露、滥用，导致您遭受诈骗、骚扰等不法侵害。
三、法律建议
谨慎对待身份证使用：
- 切勿轻易将身份证借给他人使用，即使对方是您熟悉的公司或个人。在提供身份证复印件时，务必注明用途和有效期，并加盖“再次复印无效”等字样。
及时了解身份证使用情况：
- 定期查询个人征信记录、企业信用信息公示系统等，了解是否有未经您同意的公司或个人使用您的身份证进行注册或申请相关资质。
依法维权：
- 如果发现公司未经您同意使用您的身份证进行专精特新企业认定申请或其他违法活动，您有权要求公司立即停止侵权行为，并可以向公安机关报案或向法院提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
总结来说，公司申请专精特新使用您的身份证可能对您产生一定影响，具体取决于身份证的使用方式和目的。为了保护自己的合法权益，建议您谨慎对待身份证的使用，并及时了解身份证的使用情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。