结论前置：投诉人撤诉后，市场监管部门是否还要罚款需分情况讨论，具体如下：
若投诉事项同时涉及违法行为且市场监管部门已立案调查
根据《市场监督管理行政处罚程序规定》，行政处罚的启动不依赖于投诉人是否撤诉，而是以是否存在违法行为为前提。若市场监管部门在调查中已掌握充分证据证明被投诉方存在违反市场监管法律法规的行为（如虚假宣传、价格欺诈、产品质量不合格等），即使投诉人撤诉，市场监管部门仍可依法作出行政处罚，包括罚款。
法律依据：《市场监督管理行政处罚程序规定》第十九条明确，立案与否取决于“是否有违法行为发生”，而非投诉人是否撤诉。
若投诉事项仅涉及民事纠纷且未触发行政违法调查
若投诉内容仅涉及消费者与商家之间的民事争议（如退换货、服务质量等），且未涉及违反市场监管法律法规的行为，市场监管部门通常仅作为调解方介入。此时若投诉人撤诉，市场监管部门一般不会主动对商家进行行政处罚，包括罚款。
例外情形：若在调解过程中发现商家存在行政违法行为（如未明码标价、强制交易等），市场监管部门可依职权启动行政调查，即使投诉人撤诉，仍可能作出处罚。
若投诉人撤诉前市场监管部门已作出处罚决定
若市场监管部门在投诉人撤诉前已依法作出罚款决定，该决定具有法律效力，不会因投诉人撤诉而自动撤销。商家需按决定履行罚款义务，否则可能面临强制执行或信用惩戒。
救济途径：商家若对处罚决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
总结建议：投诉人撤诉仅影响民事调解程序，不直接影响行政处罚的独立性。商家是否被罚款，关键在于是否存在行政违法行为及市场监管部门是否已启动行政调查。若您面临此类情况，可进一步提供具体细节（如投诉内容、是否收到调查通知等），我将为您分析法律风险及应对策略。