在法院处理买卖合同案件时，若发现存在民间借贷案件，一并处理的依据主要来源于法律对关联案件合并审理的规定以及司法实践中的操作惯例。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律层面的依据
《民事诉讼法》的相关规定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院在审理案件时，如果发现案件之间存在关联，且合并审理有利于查明事实、提高诉讼效率，可以决定将案件合并审理。在买卖合同纠纷中，如果发现双方之间还存在民间借贷关系，且该借贷关系与买卖合同纠纷有直接关联（如借款用于支付货款等），法院可能会考虑将两者合并审理。
合同关联性与诉讼经济原则：
- 买卖合同与民间借贷合同虽然属于不同的法律关系，但如果它们之间存在紧密的关联，如借款的用途直接关联到买卖合同的履行，那么将两者一并处理有助于全面、准确地查明事实，避免重复诉讼，提高诉讼效率。这符合诉讼经济原则，也是法院在司法实践中经常采用的做法。
二、司法实践中的操作
法院的自由裁量权：
- 在司法实践中，法院拥有一定的自由裁量权，可以根据案件的具体情况决定是否将关联案件合并审理。如果法院认为合并审理有助于查明事实、公正裁判，且不会给当事人造成不必要的负担，那么法院很可能会决定将买卖合同纠纷与民间借贷纠纷一并处理。
当事人的申请与法院的审查：
- 当事人也可以向法院提出将关联案件合并审理的申请。法院在收到申请后，会进行审查，判断合并审理的必要性、可行性和公正性。如果法院认为申请合理，且符合合并审理的条件，那么法院会决定将案件合并审理。
三、一并处理的可能后果与建议
可能后果：
- 如果法院决定将买卖合同纠纷与民间借贷纠纷一并处理，那么当事人需要在一个诉讼程序中解决两个法律关系的问题。这可能会增加诉讼的复杂性和难度，但也有助于全面、准确地查明事实，避免重复诉讼和矛盾裁判。
建议：
- 对于当事人而言，如果面临类似情况，建议积极与法院沟通，了解合并审理的可能性和必要性。同时，当事人也应准备充分的证据和材料，以支持自己的主张和请求。如果当事人对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助和指导。
总结来说，法院在处理买卖合同案件时，如果发现存在民间借贷案件，且两者之间存在紧密关联，那么法院可能会根据法律的规定和司法实践中的操作惯例，决定将两者一并处理。这有助于全面、准确地查明事实，提高诉讼效率，避免重复诉讼和矛盾裁判。如果您面临类似情况或有任何疑问，请直接向我咨询。