当您已经提交了离职申请，但工资却未结清时，这确实是一个需要关注并妥善处理的问题。以下是一些详细的步骤和建议，希望能帮助您维护自己的合法权益：

一、了解法律规定

首先，您需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是您的合法权益，也是您后续维权的基础。

二、与用人单位协商沟通

1. 主动沟通：

   • 您应该主动与用人单位的人力资源部门或直接上级进行沟通，明确询问工资未结清的具体原因。
   • 同时，询问他们预计的支付时间，以便您能够了解整个情况的进展。

2. 保留证据：

   • 在沟通过程中，务必保留好相关的聊天记录、邮件往来等证据。
   • 这些证据在后续的维权过程中可能会起到关键作用，因此请务必妥善保管。

三、采取法律手段维权

如果与用人单位的协商沟通无果，您可以考虑采取以下法律手段来维护自己的权益：

1. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果您认为用人单位存在明显的违法行为，且希望通过行政手段快速解决，那么向当地人力资源和社会保障局的劳动监察大队进行投诉是一个不错的选择。
   • 在投诉时，请携带好您的身份证、劳动合同、工资条等相关材料，以便劳动监察部门能够依法对用人单位进行调查处理。

2. 申请劳动仲裁：

   • 如果您与用人单位之间存在争议，且需要通过仲裁机构进行裁决，那么您可以考虑申请劳动仲裁。
   • 在申请劳动仲裁前，请准备好仲裁申请书、身份证明、劳动合同、工资支付记录等证据材料。
   • 提交申请后，按照要求参加庭审，并等待仲裁结果。如果裁决支持您的诉求，用人单位需在规定期限内支付工资。

3. 提起诉讼：

   • 如果您对劳动仲裁结果不满意，或者用人单位拒不履行仲裁裁决，那么您可以在收到仲裁裁决书后的法定期限内（一般为15日）向人民法院提起诉讼。
   • 法院将依法审理案件，并作出判决。如果判决支持您的诉求，用人单位将需要履行支付工资的义务。

四、注意事项

1. 及时行动：

   • 发现工资未结清后，请尽快采取行动，避免错过维权时效。因为时间一长，可能会增加维权的难度和成本。

2. 保留证据：

   • 在整个过程中，务必保留好所有与工资支付相关的证据。这些证据是您维权的重要依据，因此请务必妥善保管。

3. 合法维权：

   • 在维权过程中，请遵守法律法规，不得采取过激行为或非法手段。因为过激行为或非法手段不仅可能无法解决问题，还可能给您带来不必要的麻烦和损失。

希望以上建议能够对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或困难，请随时咨询相关部门或专业人士以获取更具体的帮助和指导。