纪委在同一个案件中对不认罪的涉案人员，会依据党纪国法及相关证据进行客观公正的处理，不会因涉案人员不认罪而改变处理原则，但具体处理方式会因案件性质、证据情况等因素有所不同。以下分情况详细说明：
证据确实充分的情况
- 如果纪委已经掌握了确凿的证据，能够充分证明涉案人员的违纪违法行为，那么即使涉案人员不认罪，纪委也会依据党纪国法对其作出相应的处理。例如，在贪污受贿案件中，如果纪委掌握了涉案人员收受财物的直接证据，如转账记录、证人证言、涉案人员的自书材料等，且这些证据之间能够相互印证，形成完整的证据链，那么即使涉案人员拒不承认，纪委也会根据证据情况，依据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，对其作出开除党籍、开除公职等处分决定，并移送司法机关追究刑事责任。
证据存在瑕疵或不足的情况
- 如果纪委掌握的证据存在瑕疵或不足，无法充分证明涉案人员的违纪违法行为，那么涉案人员的不认罪态度可能会对案件的处理产生一定影响。在这种情况下，纪委可能会进一步开展调查工作，收集更多的证据来完善证据链。如果经过进一步调查，仍然无法获取足够的证据来证明涉案人员的违纪违法行为，那么纪委可能会根据“疑罪从无”的原则，对涉案人员作出相应的处理，如不予处分或从轻处分。但需要注意的是，这里的“疑罪从无”原则在党纪处分中并不完全等同于刑事诉讼中的原则，纪委在处理案件时，还会综合考虑涉案人员的行为性质、情节、后果以及社会影响等因素。
涉案人员态度恶劣或拒不配合的情况
- 如果涉案人员不仅不认罪，还态度恶劣、拒不配合纪委的调查工作，如拒绝交代问题、隐瞒事实真相、伪造证据等，那么纪委可能会根据其态度和行为情节，对其作出更严厉的处理。例如，在纪律审查过程中，如果涉案人员拒不交代自己的违纪违法行为，且存在串供、伪造证据等妨碍调查行为，那么纪委可能会依据相关规定，对其从重或加重处分。
涉案人员存在自首、立功等情节的情况
- 如果涉案人员虽然最初不认罪，但在调查过程中能够主动交代问题、认罪悔罪，并存在自首、立功等情节，那么纪委可能会根据其情节和表现，对其作出从轻或减轻处分的决定。例如，在贪污受贿案件中，如果涉案人员在纪委调查期间能够主动交代自己的违纪违法行为，并积极退缴赃款赃物，且存在立功表现，如检举揭发他人违纪违法行为等，那么纪委可能会依据相关规定，对其从轻或减轻处分。