在合同中同时约定了总金额及天数计算方式，但金额对不上的情况下，应当优先依据合同中的明确约定来确定计算方式，若合同中对此有特别条款说明，则按照特别条款执行；若合同未明确或存在歧义，则可能需要通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径解决。以下是对此问题的详细分析：

一、合同优先原则

1. 明确约定优先：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。因此，在合同中明确约定的总金额或天数计算方式，应当作为首要依据。如果合同中明确规定了总金额，并且该金额与天数计算方式得出的结果不一致，但合同中并未规定以何种方式为准，那么通常应当以合同明确约定的总金额为准，除非该约定存在违法或显失公平等情形。
2. 特别条款优先：如果合同中除了总金额和天数计算方式外，还包含了关于金额对不上时的特别条款，如“若按天数计算金额与总金额不一致，以总金额为准”或“以天数计算金额为准”等，那么应当按照这些特别条款来执行。

二、合同未明确或存在歧义时的处理

1. 协商与调解：如果合同中未明确规定金额对不上时的处理方式，或者规定存在歧义，双方可以首先尝试通过协商或调解来解决争议。在协商或调解过程中，双方可以就合同条款的解释、计算方式的适用等问题进行充分沟通，以达成一致意见。
2. 仲裁或诉讼：如果协商或调解无法达成一致意见，双方可以根据合同中的仲裁条款或事后达成的仲裁协议，将争议提交仲裁机构进行仲裁。如果合同中没有仲裁条款或事后未达成仲裁协议，任何一方都可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序来解决争议。

三、实际操作建议

1. 审查合同条款：在签订合同时，双方应当仔细审查合同条款，确保合同中的总金额、天数计算方式以及金额对不上时的处理方式等条款明确、具体、无歧义。
2. 保留证据：在合同履行过程中，双方应当妥善保留与合同履行相关的证据，如交易记录、沟通记录等，以便在发生争议时能够提供有力的证据支持自己的主张。
3. 及时咨询专业律师：如果双方在合同履行过程中遇到金额对不上等争议问题，且无法自行解决时，应当及时咨询专业律师，以便获得专业的法律意见和帮助。

举例说明：假设一份合同中约定了总金额为10万元，同时约定了按照每天1000元的标准计算费用，但合同未明确规定若按天数计算金额与总金额不一致时以何种方式为准。如果实际履行过程中，按照天数计算得出的金额为12万元（即履行了120天），与合同约定的总金额10万元不一致。此时，如果合同中没有特别条款说明以何种方式为准，那么双方应当首先尝试通过协商或调解来解决争议。如果协商或调解无果，任何一方都可以根据合同中的仲裁条款或事后达成的仲裁协议提交仲裁，或者向人民法院提起诉讼。

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