工程设立专项质量保证金，金额为签约合同价的5%，这一做法是否合法，需结合具体情况分析：

1. 合法性基础：

   • 根据《建设工程质量保证金管理办法》第七条，发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额不得高于工程价款结算总额的3%。这一规定明确了质量保证金的最高限额，即不得超过工程价款结算总额的3%。

2. 具体分析：

   • 若签约合同价等同于工程价款结算总额：在此情况下，若质量保证金金额为签约合同价的5%，则明显超过了法定最高限额3%，因此这一做法是不合法的。
   • 若签约合同价不等于工程价款结算总额：理论上，如果签约合同价低于工程价款结算总额，且5%的签约合同价未超过工程价款结算总额的3%，则这种做法可能不违法（但实际操作中这种情况较为罕见，因为通常签约合同价会作为工程价款结算的基础）。然而，更常见且合理的情况是，签约合同价会接近或等于工程价款结算总额，因此5%的签约合同价作为质量保证金很可能仍然会超过法定限额。
   • 特殊情况：如果合同双方通过特别约定，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，同时不损害国家、集体或第三人的利益，那么双方可以就质量保证金的金额进行协商。但即便如此，这种约定也很难被认定为合法，因为它仍然违反了《建设工程质量保证金管理办法》中关于保证金最高限额的强制性规定。

3. 法律后果：

   • 如果发包人预留的质量保证金超过了法定限额，承包人有权要求发包人返还超出部分的金额。
   • 此外，发包人还可能因违反相关规定而面临行政处罚或其他法律责任。

4. 建议：

   • 在签订建设工程施工合同时，双方应明确约定质量保证金的金额和预留方式，并确保该约定符合《建设工程质量保证金管理办法》的相关规定。
   • 如果合同中约定的质量保证金金额超过了法定限额，承包人应及时与发包人协商修改合同条款，以避免潜在的法律风险。

总结来说，工程设立专项质量保证金时，其金额通常不得超过工程价款结算总额的3%。若签约合同价等同于工程价款结算总额，则5%的质量保证金金额显然不合法。在实际操作中，建议双方严格遵守相关法律法规的规定，以确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。