最高额保证合同约定的债权发生期间超过三年是合法的，但需满足一定条件，以下从多个角度进行分析：
一、法律依据与解释
根据《中华人民共和国民法典》第六百九十二条的规定，保证期间是确定保证人承担保证责任的期间，该期间不发生中止、中断和延长。债权人与保证人可以约定保证期间，但约定的保证期间不得早于主债务履行期限或者与主债务履行期限同时届满，否则视为没有约定。若未约定或约定不明确，则保证期间为主债务履行期限届满之日起六个月。
关键点解析：
保证期间的约定自由：债权人与保证人在不违反法律法规强制性规定的前提下，可以自由约定保证期间的长短，包括超过三年。这是双方意思自治的体现，也是民法基本原则之一。
保证期间的性质：保证期间具有稳定性和不可变更性，一旦确定，就不会因任何诉讼行为或其他事由而发生中止、中断或延长。这一特性确保了保证期间的法律效力，使得债权人和保证人都能够明确自己的权利和义务边界。
二、最高额保证合同的特点与债权发生期间
最高额保证合同是指保证人与债权人约定，由保证人在最高债权额限度内就一定期间连续发生的债权提供保证的合同。在最高额保证合同中，债权发生期间是指保证人承担保证责任的债权发生的时间范围。
分析：
债权发生期间的约定：债权发生期间可以由债权人与保证人自由约定，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，且不存在其他导致保证合同无效的情形，就是合法的。因此，债权发生期间超过三年，并不违反法律规定。
最高额保证的特殊性：在最高额保证合同中，由于保证的是一定期间内连续发生的债权，因此债权发生期间的长短会直接影响到保证人的责任范围。但只要债权发生期间的约定合法有效，保证人就需要在该期间内对符合约定的债权承担保证责任。
三、法律建议与风险提示
明确约定债权发生期间：在签订最高额保证合同时，债权人与保证人应明确约定债权发生期间的具体范围，以避免后续可能产生的争议。
注意保证期间的衔接：虽然债权发生期间可以超过三年，但保证期间（即保证人承担保证责任的期间）的约定也需谨慎。保证期间应合理且明确，以确保债权人的权益得到充分保障。
审查合同条款：在签订合同时，双方应仔细审查合同条款，确保所有约定均符合法律法规的规定，且不存在其他可能导致合同无效或产生争议的情形。
及时行使权利：在保证期间内，债权人应及时行使权利，要求保证人承担保证责任。若债权人未在保证期间内行使权利，则保证人可能免除保证责任。
总结：最高额保证合同约定的债权发生期间超过三年是合法的，但需确保该约定不违反法律法规的强制性规定，且不存在其他导致保证合同无效的情形。在签订合同时，双方应明确约定债权发生期间和保证期间，并仔细审查合同条款，以确保自身权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。