关于最高额保证合同保证期限由债权人后来填写是否有效的问题，结论需分情况讨论：

1. 若保证期限条款为空白或未约定，债权人后续填写且保证人认可或追认的，该条款有效
   根据《民法典》第六百八十五条，保证合同可以是单独订立的书面合同，也可以是主债权债务合同中的保证条款。若最高额保证合同中保证期限条款原本为空白或未约定，债权人后续填写后，若保证人以书面形式或其他方式明确表示认可（如签字、盖章、出具书面确认函等），则该条款对保证人产生约束力。
   法律背景：保证合同属于诺成性合同，双方意思表示一致即成立。若保证人未对债权人填写的期限提出异议，或通过行为表明接受（如继续履行保证义务），可视为对合同内容的补充约定。

2. 若保证期限条款为空白或未约定，债权人单方填写且保证人未追认的，该条款无效
   若债权人未经保证人同意，单方填写保证期限并主张权利，保证人可主张该条款无效。此时，保证期限应适用法定规则：

   • 根据《民法典》第六百九十二条，保证期间没有约定或约定不明确的，保证期间为主债务履行期限届满之日起六个月。
     法律后果：债权人需在法定保证期间内主张权利，否则保证人免除保证责任。

3. 若保证期限条款被篡改（如债权人擅自修改已约定的期限），且保证人能证明篡改事实的，修改部分无效
   若合同原已约定保证期限，债权人未经保证人同意擅自修改（如延长或缩短期限），保证人可主张修改部分无效。此时需结合以下证据判断：

   • 合同原始文本、签订时的沟通记录（如邮件、微信）；
     
   • 保证人是否在修改后提出异议；
     
   • 修改是否影响保证人核心权益（如期限过长加重保证人负担）。
     法律背景：根据《民法典》第一百四十八条，一方以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求撤销。

实务建议：

• 对保证人而言：签订最高额保证合同时，务必明确约定保证期限，避免条款空白；若发现债权人单方填写或修改期限，应立即提出书面异议并留存证据。
  
• 对债权人而言：若需补充或修改保证期限，应与保证人协商一致并签署补充协议，避免因程序瑕疵导致权利落空。
  

进一步思考：若合同中约定“保证期限由债权人确定”，此类条款是否有效？根据《民法典》第四百九十七条，若该条款导致保证人承担过重责任且显失公平，保证人可主张撤销。但实务中需结合具体交易背景判断（如保证人是否为专业机构、是否收取对价等）。

如有具体合同文本或案情细节，可进一步向我咨询，我会结合条款内容提供针对性分析。