村集体土地确权村委未经过小组，其合法性需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
合法情况
符合民主议定程序：
- 如果村委在确权过程中，严格遵循了民主议定程序，例如经过了本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意，并且这一程序符合《农村土地承包法》等相关法律法规的规定，那么村委未直接经过小组而进行的确权行为，在程序上可能是合法的。这通常发生在因土地历史遗留问题或土地调整的现实需求等特定情境下，且必须确保整个过程的合法性、公正性和透明度。
土地权属依法认定归小组：
- 当村集体土地的权属存在争议时，若经过调查核实及相关部门依法认定，确认土地集体所有权归村民小组，那么村委在此基础上进行的确权操作，即使未直接经过小组，也是合法合规的。这种情况下，确权行为是基于土地权属的法定认定，而非简单的行政决定。
不合法情况
违反法定程序：
- 如果村委在确权过程中，未经过法定的民主决策程序，例如未经村民会议三分之二以上成员或代表同意，擅自将村集体土地确权，这种行为侵害了农民的合法权益，属于不合法行为。因为土地确权涉及到农民的切身利益，必须确保农民的知情权、参与权和申诉权得到充分保障。
与已有合法权属证明冲突：
- 若村集体土地已经存在合法的权属证明，如土地承包经营权证、宅基地使用证等，且这些证明在有效期内，村委无法定理由和合法程序即改变原有权属关系，进行确权操作，这种确权行为同样是不合法的。因为权属证明是农民对土地享有权利的法定凭证，任何改变都必须经过法定程序和条件。
法律建议与风险提示
- 确保程序合法：村委在进行土地确权时，必须严格遵守相关法律法规和民主议定程序，确保整个过程的合法性、公正性和透明度。这有助于避免因程序违法而引发的纠纷和诉讼。
- 保障农民权益：土地确权是确认农民对土地权利的重要过程，必须充分保障农民的知情权、参与权和申诉权。村委应积极与农民沟通协商，确保农民的合法权益不受损害。
- 咨询专业法律人士：由于土地确权涉及复杂的法律关系和程序要求，村委在操作过程中如有任何疑问或争议，应及时咨询专业法律人士或相关政府部门，以确保确权行为的合法性和有效性。
在实际操作中，判断村集体土地确权村委未经过小组是否合法，应综合考虑上述各方面因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。