结论：甲乙双方都使用自己公司的公章在合同上加盖，这一行为本身并不直接决定合同的有效性，合同的有效性取决于多个因素，包括但不限于双方的意思表示是否真实、合同内容是否合法、是否违反法律法规的强制性规定等。
详细分析：
公章的法律意义：
- 公章是公司对外表示其意思表示的重要工具，具有法律效力。在合同上加盖公章，通常代表公司对该合同的认可和接受。
- 然而，公章的使用并不总是意味着合同一定有效。合同的有效性还取决于合同内容、双方的意思表示是否真实、是否违反法律法规等。
合同有效性的判断标准：
- 意思表示真实：双方在签订合同时，必须是在自愿、平等、公平的基础上，真实表达自己的意愿。如果一方存在欺诈、胁迫等行为，导致对方意思表示不真实，则合同可能无效。
- 内容合法：合同的内容必须符合法律法规的规定，不得违反法律法规的强制性规定。如果合同内容违法，则合同无效。
- 形式合法：虽然公章的使用是合同形式的一部分，但合同的形式合法性还涉及其他方面，如合同是否采用书面形式（除非法律另有规定）、是否按照法定程序签订等。
双方都使用自己公司公章的情况：
- 在这种情况下，如果双方都是依法设立的公司，且公章的使用符合公司章程和法律法规的规定，同时合同内容合法、双方意思表示真实，那么合同通常是有效的。
- 但是，如果存在一方或双方公章使用不当（如未经授权使用、伪造公章等）、合同内容违法或双方意思表示不真实等情况，则合同可能无效或可撤销。
特殊情况考虑：
- 如果甲乙双方签订的合同涉及特殊行业或特殊交易（如金融、证券、房地产等），可能需要满足特定的法律要求或监管规定。在这种情况下，即使双方都使用了自己公司的公章，如果合同未满足相关要求或规定，也可能导致合同无效或受到处罚。
- 另外，如果合同中存在格式条款或免责条款等可能对一方不公平的内容，也需要根据法律法规的规定进行审查和判断。
建议：
- 在签订合同时，双方应确保公章的使用符合公司章程和法律法规的规定，并确保合同内容合法、双方意思表示真实。
- 如果对合同的有效性存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师进行法律分析和判断。
- 在涉及特殊行业或特殊交易的情况下，应特别注意满足相关法律要求或监管规定，以避免合同无效或受到处罚的风险。
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