结论：行贿人利用受贿人职务影响获得工程承揽后又违法转包他人获取转包费用，该转包费用一般不算作违纪款，但可能涉及违法所得，需依法追缴，同时行贿和受贿行为本身构成犯罪，需承担刑事责任。以下从多个角度进行分析：
一、违纪款与违法所得的区分
- 违纪款：通常指的是违反党纪、政纪规定所获得的财物或利益。它主要关注的是行为是否违反了党内的纪律或行政机关的纪律规定。
- 违法所得：则是指因违法行为所获得的财物或利益。它关注的是行为是否违反了法律法规，并因此获得了不正当的利益。
在您描述的情况中，行贿人通过行贿手段获得工程承揽，这本身已经构成了行贿罪，而受贿人则构成了受贿罪。行贿人后续违法转包工程并获取转包费用，这一行为进一步违反了工程承揽和转包的相关法律法规，因此该转包费用应被视为违法所得，而非违纪款。
二、违法所得的处理
根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
因此，行贿人通过违法转包获得的转包费用，作为违法所得，应当被依法追缴，并上缴国库。
三、行贿和受贿行为的刑事责任
- 行贿罪：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十九条的规定，为谋取不正当利益，给予国家工作人员以财物的，是行贿罪。在经济往来中，违反国家规定，给予国家工作人员以财物，数额较大的，或者违反国家规定，给予国家工作人员以各种名义的回扣、手续费的，以行贿论处。行贿人将面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节严重的，将面临五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节特别严重的，将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
- 受贿罪：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十五条的规定，国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物的，或者非法收受他人财物，为他人谋取利益的，是受贿罪。受贿人将面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，将面临三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或者没收财产；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
四、综合建议
- 行贿人：应立即停止一切违法行为，主动向有关部门投案自首，并积极配合调查，争取从轻或减轻处罚。同时，应主动退缴违法所得，以减轻法律后果。
- 受贿人：同样应立即停止违法行为，主动向有关部门投案自首，并积极配合调查。受贿人作为国家工作人员，其违法行为不仅损害了国家利益，也破坏了社会公平正义，因此应承担更重的法律责任。
如果您或您身边的人涉及此类问题，请直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律建议和帮助。