在交通事故官司中，针对对方提出的非医保用药和医疗费关联性鉴定，这通常会对案子的进展产生一定影响，但具体后果需结合案件实际情况和法律规定来综合分析。以下是对此问题的详细解答：
一、非医保用药的赔偿问题
在机动车交通事故责任纠纷中，被侵权人的医疗费是法定赔偿项目。然而，赔偿义务人（如保险公司）常以医疗费中存在“非医保”用药为由进行抗辩，主张不予赔付。但根据相关法律法规和司法实践，非医保用药费用并不应直接扣除。原因如下：
医疗用药的不可预见性：治疗过程中，无论是侵权人还是被侵权人，对于医疗机构针对病情采取的治疗方式和用药范围均无法预见和控制。因此，将非医保用药费用直接扣除，对被侵权人而言显失公平。
保险合同的格式条款问题：保险公司在保险合同中可能包含关于扣除非医保用药的格式条款。但这类条款往往倾向于免除或限制保险公司的责任，可能因未尽到明确说明义务而被认定为无效。此外，格式条款内容繁多，合同相对方可能难以注意到对自身不利的免责条款。
法律法规的支持：根据《中华人民共和国民法典》和《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》的相关规定，医疗费是根据医疗机构出具的医药费、住院费等收款凭证，结合病历和诊断证明等相关证据确定的。赔偿义务人对治疗的必要性和合理性有异议的，应当承担举证责任。这意味着，除非保险公司能证明非医保用药费用缺乏合理性或必要性，否则应予以赔付。
二、医疗费关联性鉴定的影响
如果对方提出对医疗费进行关联性鉴定，这通常是为了证明某些医疗费用与交通事故造成的伤害无直接关联，从而主张不予赔付。这种鉴定可能对案子进展产生以下影响：
增加诉讼成本和时间：关联性鉴定需要一定的时间和费用，可能延长案件的审理周期，并增加当事人的诉讼成本。
影响赔偿金额：如果鉴定结果认为某些医疗费用与交通事故无直接关联，那么这部分费用可能不会被计入赔偿范围，从而影响最终的赔偿金额。
举证责任的分配：在关联性鉴定中，提出鉴定的一方（通常是赔偿义务人）需要承担举证责任，证明医疗费用与交通事故无直接关联。如果无法提供充分证据，则可能承担不利后果。
三、综合建议
积极应对鉴定：如果对方提出关联性鉴定，应积极配合并提供相关证据，以证明医疗费用的合理性和必要性。
审查保险合同：仔细审查保险合同中关于非医保用药的条款，确认保险公司是否尽到了明确说明义务。如果保险公司未尽到义务，则相关条款可能无效。
寻求专业法律帮助：在处理此类纠纷时，建议寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自身权益。
综上所述，非医保用药和医疗费关联性鉴定在交通事故官司中可能对案子进展产生一定影响。但根据相关法律法规和司法实践，非医保用药费用并不应直接扣除，而关联性鉴定则需要根据具体情况和证据来综合判断。