核心结论：三人共同承包土地合同分户后，需根据分户具体情况，通过协商变更合同、重新签订合同或依法分割权益等方式处理，以确保各方合法权益。以下为具体分析：
分户后合同主体变更问题
- 若分户导致原共同承包人中的部分成员退出承包关系，或新增成员加入，则原共同承包合同主体已发生实质性变更。此时，应依据《农村土地承包法》第三十五条之规定，由剩余承包方与发包方协商一致，对原合同进行变更，明确新的承包方、承包期限、承包土地的坐落、面积等关键条款，并签订书面变更协议。若新增成员加入，还需确保其符合法律规定的承包资格条件，如具有本集体经济组织成员身份等。
- 若分户后，原共同承包人仍共同承包该土地，仅内部权益分配发生变化，则原合同主体未变更，无需变更原合同，但建议各方签订内部协议，明确各自在承包土地上的权益份额、管理责任、收益分配等事项，以避免后续纠纷。
分户后土地权益分割问题
- 若分户导致原共同承包的土地需要分割，应遵循公平、合理、自愿的原则，由各方协商确定分割方案。分割方案应明确分割后各方的土地边界、面积、质量等，并尽可能保持土地的完整性和利用效率。若协商不成，可请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解，或依法向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。
- 在分割土地权益时，还需注意遵守法律、行政法规的强制性规定，如不得改变土地的农业用途，不得破坏土地的生态环境等。若分割方案违反这些规定，将可能导致分割无效或受到行政处罚。
分户后合同履行与责任承担问题
- 分户后，无论合同是否变更，各方均应继续履行原合同或变更后的合同义务，如按时缴纳承包费、合理利用和保护土地等。若一方未履行或未完全履行合同义务，应承担相应的违约责任，如赔偿损失、支付违约金等。
- 若因分户导致原共同承包人之间的内部责任划分发生变化，如某一方承担了更多的管理责任或风险，建议在内部协议中明确约定责任承担方式，以避免后续纠纷。若内部协议未约定或约定不明，可依据《民法典》关于合伙合同的相关规定，按照出资比例、贡献大小等因素合理确定责任承担比例。