员工服刑期间，公司不能擅自中断其社会保险。下面我从几个角度来解释这个问题：

1. 法律规定：根据《中华人民共和国社会保险法》和相关规定，社会保险是国家为了保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利而建立的制度。员工服刑期间，虽然其人身自由受到限制，但其社会保险权益并不因此自动丧失。

2. 社保关系的连续性：社会保险关系是基于员工与用人单位之间的劳动关系而建立的。除非员工与用人单位的劳动关系依法终止（如合同到期、解雇等），否则用人单位有义务继续为员工缴纳社会保险费。员工服刑并不构成劳动关系终止的法定事由。

3. 实际操作：在实际操作中，如果员工因犯罪被判刑，用人单位通常不会因此直接中断其社会保险。而是会根据具体情况，如员工服刑期间是否仍保留劳动关系、是否继续支付工资等，来决定是否继续缴纳社保。但无论如何，用人单位不能擅自中断员工的社会保险。

4. 员工权益保护：员工服刑期间，其社会保险权益仍应受到保护。如果用人单位擅自中断员工的社会保险，可能会侵犯员工的合法权益，员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。

综上所述，员工服刑期间，公司不能擅自中断其社会保险。如果用人单位在这方面有任何疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询。