私下股份协议在符合相关法律法规及公序良俗的前提下，通常是合法的，但也可能存在特定情形导致协议无效或部分无效。以下是对此问题的详细分析：
一、私下股份协议合法的条件
行为人具备民事行为能力：
- 签署私下股份协议的各方当事人必须为精神正常、年满18周岁的成年人（或依法被视为具有完全民事行为能力的其他情况），以确保其能够理解协议内容、预见行为后果，并独立表达意愿。
意思表示真实：
- 协议内容必须是各方当事人自愿、平等协商后达成的真实意愿表示，不存在欺诈、胁迫、重大误解等不正当手段影响。例如，若一方在签订协议时受到另一方的欺诈或胁迫，该协议可能因意思表示不真实而被认定无效。
内容合法且不违反公序良俗：
- 协议中关于股权转让、股份分配、权利义务等条款不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得损害国家、集体或第三人的合法权益，更不能违背社会公共秩序和善良风俗。例如，协议中若约定股东可以抽逃出资，这违反了《公司法》关于公司资本维持原则的强制性规定，该条款将被认定无效。
形式符合要求：
- 股份协议应采用书面形式，明确记载双方信息、股份比例、出资方式、权利义务等关键内容。若法律或行政法规有特别要求，还需办理相应的批准或登记手续。例如，涉及国有股权转让的私下股份协议，需经过国有资产监督管理部门的审批等一系列法定程序才会生效。
二、可能导致私下股份协议无效的情形
违反法律、行政法规的强制性规定：
- 如协议约定股东可以抽逃出资、违规分配利润等行为，均违反了相关法律法规的强制性规定，该协议或相关条款将被认定无效。
恶意串通损害他人权益：
- 若协议各方当事人恶意串通，以损害国家、集体或第三人合法权益为目的，整个协议将被认定为无效。例如，股东为了逃避公司债务，通过私下协议将公司的优质资产分配给部分股东，这种行为损害了公司利益和债权人利益，违反了《公司法》的相关规定，因此该协议无效。
以合法形式掩盖非法目的：
- 如协议表面上是合法的股份转让，但实际上是为了掩盖洗钱、非法集资等非法活动，该协议将被认定无效。
主体不适格：
- 如无民事行为能力人签订的股份协议，由于其不具备相应的民事行为能力，协议将被视为无效。
三、实际操作中的注意事项
法律效力范围：
- 即使私下股份协议有效，它也仅在协议签订各方之间产生法律效力，不能对抗善意第三人。涉及公司股权登记等事项时，还需按法律规定和公司章程操作。例如，未经工商行政管理部门进行股权变更登记的股权转让，可能仅对协议双方有内部约束力，无法对抗善意第三人。
履行风险与争议解决：
- 协议有效并不意味着一定能够完全履行。在实际操作中，可能因各种原因导致履行困难或产生争议。因此，建议在签订前充分评估风险，并考虑在协议中约定争议解决机制，如仲裁或诉讼等。
公司章程的遵守：
- 如果公司章程对股权的转让、协议等有特别规定，私下签订的股份协议也不得违反这些规定，否则可能影响协议的效力。例如，公司章程规定公司利润必须先提取法定公积金后才能进行分配，但股东私下协议在未提取法定公积金的情况下就对利润进行了分配，这种协议违反了公司章程的规定，可能被认定为无效。
总结与建议：私下股份协议的合法性取决于多个因素的综合判断，包括行为人的民事行为能力、意思表示的真实性、内容的合法性以及形式的合规性等。为确保协议的有效性和避免法律风险，建议当事人在签订协议前充分了解相关法律法规和公司章程的规定，并谨慎行事。若您对私下股份协议的合法性或具体操作有疑问，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。