结论：取保候审结束后公安机关退还了保证金，过了三年多再没下文，这种情况可能意味着案件已经终结，但也不排除其他可能性。以下从多个角度进行分析：

1. 案件终结的可能性：

   • 法律程序完成：取保候审是刑事诉讼中的一种强制措施，其期限通常不超过十二个月。如果在此期间内，公安机关没有提起公诉或者案件被撤销，那么取保候审就会自动解除，保证金也会被退还。如果三年多过去了，没有收到任何进一步的法律文书或通知，很可能意味着案件已经终结，不再继续追究刑事责任。
   • 不起诉决定：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。如果公安机关在侦查阶段认为案件不符合起诉条件，或者人民检察院作出了不起诉决定，那么案件也会终结，不再继续追究。

2. 其他可能性的探讨：

   • 未收到通知：虽然可能性较小，但也不能完全排除由于某种原因（如地址变更、联系方式失效等）导致您没有收到相关的法律文书或通知。这种情况下，您可以主动联系公安机关或人民检察院，了解案件的具体情况。
   • 案件重新启动：在极少数情况下，如果公安机关或人民检察院在后续发现了新的证据或线索，认为有必要重新追究刑事责任，那么案件可能会重新启动。但这种情况通常会在较短的时间内发生，而不是三年多之后。

3. 建议与行动：

   • 主动查询：如果您对案件的状态感到不安或疑惑，可以主动联系当时办理取保候审的公安机关或相关的人民检察院，查询案件的具体情况。他们应该能够提供案件的最新进展或终结信息。
   • 保留证据：如果您曾经收到过与案件相关的任何法律文书或通知，请妥善保留这些证据。这些证据可能在未来需要时起到关键作用。
   • 法律咨询：如果您对案件的处理结果有任何疑问或不满，或者认为自己的合法权益受到了侵害，可以寻求专业的法律咨询。作为专业律师，我可以根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。

总结与进一步思考：取保候审结束后公安机关退还了保证金，过了三年多再没下文，通常意味着案件已经终结。但为了确保自己的权益不受侵害，您可以主动查询案件状态，并保留好相关证据。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。