核心结论：征地几年后不认可签字并申请笔迹鉴定，在符合法定条件且鉴定程序合法的情况下，鉴定结果具有法律效力，可作为认定签字真实性的依据；但若因超过诉讼时效、证据保存不当等原因，可能影响鉴定申请的受理或鉴定结果的采信。以下从不同角度展开分析：

1. 笔迹鉴定的法律效力

• 法律依据：根据《民事诉讼法》第七十六条，当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。笔迹鉴定属于法定鉴定事项之一，其结果经法庭审查属实后，可作为认定事实的依据。
• 鉴定条件：需满足以下条件：
  • 样本充分性：需提供与检材（被质疑签字）同时期、同书写条件下的比对样本（如同期其他文件中的签字）；
  • 鉴定机构资质：需委托具有司法鉴定资质的机构进行，避免选择无资质机构导致结果无效；
  • 程序合法性：鉴定过程需符合《司法鉴定程序通则》，包括检材提取、保存、鉴定方法等环节。

2. 时间因素对鉴定申请的影响

• 诉讼时效限制：
  • 若因签字真实性引发行政争议（如征地补偿协议纠纷），需在知道或应当知道行政行为之日起6个月内提起行政诉讼（《行政诉讼法》第四十六条）；
  • 若为民事纠纷（如合同效力争议），诉讼时效为3年（《民法典》第一百八十八条）。超过时效可能丧失胜诉权，但鉴定申请本身不受时效限制，仅影响结果采信。
• 证据保存问题：
  • 签字文件若因保管不善导致字迹模糊、纸张变质，可能影响鉴定准确性；
  • 若检材或样本被篡改、污染，鉴定机构可能拒绝受理或出具无法鉴定结论。

3. 申请鉴定的实务建议

• 步骤一：固定证据：
  • 立即对争议文件进行拍照、复印，并保存原件；
  • 收集同期其他文件中的签字作为比对样本（如银行签字、其他合同签字）。
• 步骤二：委托鉴定：
  • 通过法院委托鉴定（诉讼中）或直接委托司法鉴定机构（诉前）；
  • 优先选择本地权威机构（如省级司法鉴定中心），避免跨区域鉴定增加成本。
• 步骤三：结果运用：
  • 若鉴定结果否定签字真实性，可主张协议无效或撤销，并要求重新协商补偿；
  • 若鉴定结果支持签字真实性，需结合其他证据（如协商记录、证人证言）综合抗辩。

4. 风险提示

• 鉴定成本：笔迹鉴定费用通常由申请人预交（约2000-5000元/项），最终由败诉方承担；
• 结果不确定性：若样本不足或字迹模糊，可能得出“无法鉴定”结论，需提前评估风险；
• 行政程序衔接：若征地行为已通过行政复议或诉讼程序，需在程序中一并申请鉴定，避免程序空转。

行动建议：若您面临此类问题，建议立即整理争议文件及比对样本，委托专业司法鉴定机构进行预评估，并根据结果决定是否启动法律程序。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程及证据准备要点。