针对您提出的“公司可以让怀孕员工停工留薪吗”这一问题，我的答案是：除非是基于双方自愿协商一致且达成书面协议，否则公司要求怀孕员工停工留薪（即停薪留职）一般是不合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规依据
《中华人民共和国劳动法》：
- 第二十九条明确规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内的，用人单位不得解除劳动合同。这一条款旨在保护女性员工在特殊生理时期的合法权益，避免她们因怀孕、生育或哺乳而遭受不公正待遇。
- 第六十二条进一步规定，女职工生育享受不少于九十天的产假，这进一步保障了怀孕女职工的休息和恢复时间。
《女职工劳动保护特别规定》：
- 第五条强调，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。这确保了怀孕女职工在职场上的稳定性和经济权益不受侵害。
《中华人民共和国劳动合同法》：
- 第四十二条也明确规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这进一步强化了法律对怀孕女职工的保护。
二、停工留薪（停薪留职）的合法性分析
停薪留职的定义与本质：
- 停薪留职通常意味着员工停止工作，用人单位停止支付工资，但保留职位。对于怀孕女职工而言，这种安排实际上损害了她们获得劳动报酬的基本权利，因为她们在孕期仍然需要经济支持来维持生活和准备生育。
违法性判断：
- 除非怀孕女职工因身体等特殊原因，主动向公司提出停薪留职申请，并且双方经过协商一致后达成书面协议，否则公司单方面要求怀孕员工停薪留职很可能构成违法行为。这种行为违反了上述法律条款中关于保护孕期女职工权益的规定。
三、应对措施与建议
与公司沟通：
- 如果公司提出停薪留职的要求，您应首先尝试与公司进行友好沟通，了解公司的具体考虑和意图。
- 在沟通中，明确指出停薪留职的违法性，并要求公司恢复正常的工资待遇和工作安排。
收集证据：
- 如果公司坚持要求停薪留职或采取其他不当措施，您应开始收集相关证据，如工资条、工作记录、与公司沟通的邮件或录音等。这些证据将有助于您在后续的法律程序中维护自己的权益。
寻求法律援助：
- 咨询专业律师或当地劳动监察部门，了解自己的权益和可行的法律途径。他们可以提供专业的法律建议和帮助您制定应对策略。
- 在必要时，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
维护自身权益：
- 在整个过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的行为。
- 坚持自己的合法权益，不轻易妥协或放弃。记住，法律是保护您权益的有力武器。
综上所述，公司要求怀孕员工停工留薪（停薪留职）一般是不合法的，除非是基于双方自愿协商一致且达成书面协议。面对这种情况，您应明确自己的法律权益，与公司进行沟通协商，并在必要时寻求法律援助以维护自己的合法权益。